47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2208 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  45.36 
 
 		 1439 aa  1061    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  54.07 
 
 		 1425 aa  1402    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  45.63 
 
 		 1435 aa  1077    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  45.83 
 
 		 1437 aa  1053    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  45.72 
 
 		 1444 aa  1074    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  44.41 
 
 		 1474 aa  1032    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  54.64 
 
 		 1412 aa  1417    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  44.88 
 
 		 1451 aa  1064    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  45.8 
 
 		 1463 aa  1154    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  45.36 
 
 		 1439 aa  1061    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  44.77 
 
 		 1446 aa  1045    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  46.24 
 
 		 1440 aa  1076    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  45.2 
 
 		 1447 aa  1040    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  49.13 
 
 		 836 aa  647    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  49.88 
 
 		 836 aa  649    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  43.83 
 
 		 1421 aa  947    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  44.48 
 
 		 1414 aa  984    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  44.67 
 
 		 1448 aa  1061    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  45.86 
 
 		 1440 aa  1081    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4223  putative methylase/helicase  49.6 
 
 		 896 aa  814    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.233912  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  100 
 
 		 1413 aa  2845    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  44.24 
 
 		 1455 aa  1054    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  44.62 
 
 		 1459 aa  1047    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0437  putative methylase/helicase  94.65 
 
 		 611 aa  1143    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  88.71 
 
 		 824 aa  1456    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  46.35 
 
 		 1396 aa  1088    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  45.26 
 
 		 1498 aa  1094    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  46.46 
 
 		 1458 aa  1093    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  47.54 
 
 		 1459 aa  1120    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  46.49 
 
 		 1444 aa  1087    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  45.14 
 
 		 1449 aa  1063    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  45.24 
 
 		 1440 aa  1060    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  44.39 
 
 		 1536 aa  1165    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  44.35 
 
 		 1529 aa  1155    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  44.4 
 
 		 1440 aa  1090    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3694  hypothetical protein  44.52 
 
 		 623 aa  412  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4003  hypothetical protein  43.57 
 
 		 623 aa  407  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40550  predicted protein  33.17 
 
 		 950 aa  370  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  38.76 
 
 		 684 aa  315  5.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30868  predicted protein  32.64 
 
 		 1487 aa  206  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186936  normal  0.423198 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  36.77 
 
 		 515 aa  142  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  24.55 
 
 		 2123 aa  96.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  44.57 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  34.04 
 
 		 254 aa  75.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  27.22 
 
 		 660 aa  53.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  29.33 
 
 		 451 aa  47.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0003  helicase. putatve  22.59 
 
 		 2133 aa  46.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>