52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3065 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  78.35 
 
 		 1444 aa  2253    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  60.77 
 
 		 1463 aa  1753    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  80.64 
 
 		 1440 aa  2288    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  100 
 
 		 1448 aa  2907    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  51.41 
 
 		 1414 aa  997    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  44.12 
 
 		 1425 aa  1035    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  46.47 
 
 		 1421 aa  1114    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  76.22 
 
 		 1435 aa  2150    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  70.43 
 
 		 1437 aa  1958    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  79.97 
 
 		 1446 aa  2288    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  79.48 
 
 		 1474 aa  2276    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  44.42 
 
 		 1412 aa  981    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  81.64 
 
 		 1451 aa  2397    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  79.27 
 
 		 1439 aa  2261    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  79.27 
 
 		 1439 aa  2261    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  80.51 
 
 		 1440 aa  2301    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  93.3 
 
 		 1447 aa  2652    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  78.38 
 
 		 1440 aa  2222    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  81.14 
 
 		 1449 aa  2314    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  77.88 
 
 		 1444 aa  2222    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  51.83 
 
 		 1529 aa  1463    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  52.48 
 
 		 1536 aa  1479    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4223  putative methylase/helicase  65.9 
 
 		 896 aa  1160    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.233912  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  63 
 
 		 1498 aa  1785    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  65.65 
 
 		 1396 aa  1807    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  50.61 
 
 		 1440 aa  1337    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  58.37 
 
 		 1458 aa  1542    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  74.9 
 
 		 1459 aa  2118    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  73.67 
 
 		 1455 aa  2095    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  67.24 
 
 		 1459 aa  1876    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  44.85 
 
 		 1413 aa  1068    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  47.31 
 
 		 836 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  46.8 
 
 		 836 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  44.06 
 
 		 824 aa  590  1e-167  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  53.45 
 
 		 684 aa  570  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  74.19 
 
 		 515 aa  561  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0437  putative methylase/helicase  45.91 
 
 		 611 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3694  hypothetical protein  43.1 
 
 		 623 aa  415  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4003  hypothetical protein  43.12 
 
 		 623 aa  414  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40550  predicted protein  35.29 
 
 		 950 aa  402  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30868  predicted protein  30.92 
 
 		 1487 aa  185  7e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186936  normal  0.423198 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  65.91 
 
 		 397 aa  129  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0597  helicase  69.64 
 
 		 137 aa  87  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  23.76 
 
 		 2123 aa  79.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0003  helicase. putatve  21.26 
 
 		 2133 aa  79.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  39.44 
 
 		 254 aa  71.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  29.23 
 
 		 557 aa  55.5  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  32.33 
 
 		 187 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 658 aa  50.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  32.33 
 
 		 187 aa  50.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  32.33 
 
 		 187 aa  48.5  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  34.19 
 
 		 451 aa  45.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>