50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2494 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  52.96 
 
 		 1444 aa  1504    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  51.93 
 
 		 1440 aa  1449    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  51.77 
 
 		 1463 aa  1500    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  52.8 
 
 		 1440 aa  1488    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  51.62 
 
 		 1448 aa  1440    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  43.3 
 
 		 1425 aa  1105    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  46.08 
 
 		 1414 aa  936    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  53.28 
 
 		 1435 aa  1496    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  51.84 
 
 		 1437 aa  1418    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  51.85 
 
 		 1446 aa  1451    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  51.81 
 
 		 1474 aa  1439    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  42.36 
 
 		 1412 aa  1065    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  51.74 
 
 		 1451 aa  1468    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  42.35 
 
 		 1421 aa  1048    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  52.33 
 
 		 1439 aa  1473    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  52.33 
 
 		 1439 aa  1473    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  52.35 
 
 		 1440 aa  1462    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  51.96 
 
 		 1447 aa  1442    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  52.34 
 
 		 1449 aa  1467    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  51.08 
 
 		 1440 aa  1448    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  51.83 
 
 		 1459 aa  1464    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  44.35 
 
 		 1413 aa  1155    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  50.34 
 
 		 1458 aa  1351    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  52.62 
 
 		 1455 aa  1463    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  52.33 
 
 		 1459 aa  1466    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  51.8 
 
 		 1396 aa  1445    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  53.84 
 
 		 1498 aa  1541    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4223  putative methylase/helicase  56.19 
 
 		 896 aa  1001    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.233912  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  91.93 
 
 		 1536 aa  2911    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  51.95 
 
 		 1444 aa  1477    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  100 
 
 		 1529 aa  3160    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  42.96 
 
 		 824 aa  622  1e-176  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  44.1 
 
 		 836 aa  618  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  43.68 
 
 		 836 aa  616  9.999999999999999e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0437  putative methylase/helicase  47.76 
 
 		 611 aa  535  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  43.17 
 
 		 684 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3694  hypothetical protein  43.1 
 
 		 623 aa  432  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4003  hypothetical protein  43.35 
 
 		 623 aa  431  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40550  predicted protein  32.67 
 
 		 950 aa  376  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  39.55 
 
 		 515 aa  282  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30868  predicted protein  31.62 
 
 		 1487 aa  206  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186936  normal  0.423198 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  56.52 
 
 		 397 aa  108  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0003  helicase. putatve  20.98 
 
 		 2133 aa  92.8  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  23.39 
 
 		 2123 aa  90.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  34.69 
 
 		 254 aa  62.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0597  helicase  50 
 
 		 137 aa  60.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  29.53 
 
 		 569 aa  50.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4362  hypothetical protein  27.64 
 
 		 520 aa  48.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 658 aa  45.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  26.34 
 
 		 557 aa  45.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>