34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4362 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4362  hypothetical protein  100 
 
 		 520 aa  1075    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  38.89 
 
 		 254 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  35.89 
 
 		 557 aa  140  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  39.29 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  34.73 
 
 		 660 aa  90.1  8e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 658 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  31.18 
 
 		 449 aa  76.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  27.56 
 
 		 548 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  31.79 
 
 		 569 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0073  DNA-methyltransferase-like  29.61 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.648628 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  27.78 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  28.07 
 
 		 187 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  28.65 
 
 		 187 aa  62  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  27.49 
 
 		 187 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  31.15 
 
 		 824 aa  55.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  33.33 
 
 		 1459 aa  55.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  29.57 
 
 		 1425 aa  55.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  30.05 
 
 		 1440 aa  53.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  30.88 
 
 		 1458 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  27.35 
 
 		 1412 aa  53.5  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  31.6 
 
 		 1435 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  29.95 
 
 		 1440 aa  51.6  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  29.83 
 
 		 1414 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  31.75 
 
 		 515 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  31.72 
 
 		 1396 aa  48.9  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  27.64 
 
 		 1529 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  30.56 
 
 		 1449 aa  47.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5014  hypothetical protein  28.57 
 
 		 597 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4474  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  33.81 
 
 		 294 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.135344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  27.14 
 
 		 1536 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  28.91 
 
 		 1444 aa  43.9  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  28.89 
 
 		 836 aa  43.9  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  31.41 
 
 		 1421 aa  43.5  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>