65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3699 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  91.15 
 
 		 836 aa  1486    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  43.44 
 
 		 1529 aa  639    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  48.4 
 
 		 824 aa  655    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  43.76 
 
 		 1536 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  49.13 
 
 		 1413 aa  669    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  100 
 
 		 836 aa  1697    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  46.49 
 
 		 1440 aa  643    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  47.77 
 
 		 1435 aa  634  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  47.51 
 
 		 1444 aa  634  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  47.29 
 
 		 1444 aa  631  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  47.41 
 
 		 1447 aa  627  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  47.8 
 
 		 1396 aa  623  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  44.8 
 
 		 1463 aa  624  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  47.16 
 
 		 1440 aa  622  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  46.52 
 
 		 1451 aa  621  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  45.96 
 
 		 1412 aa  616  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  46.39 
 
 		 1440 aa  614  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  46.66 
 
 		 1448 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  46.92 
 
 		 1459 aa  614  9.999999999999999e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  47.32 
 
 		 1459 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  46.04 
 
 		 1449 aa  608  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  46.12 
 
 		 1437 aa  607  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  45.92 
 
 		 1446 aa  605  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  45.96 
 
 		 1455 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  46 
 
 		 1439 aa  599  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  46 
 
 		 1439 aa  599  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  46.31 
 
 		 1458 aa  599  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  46.72 
 
 		 1474 aa  595  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  46.16 
 
 		 1440 aa  594  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  45.25 
 
 		 1425 aa  592  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  44.7 
 
 		 1498 aa  588  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  44.65 
 
 		 1414 aa  568  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  45.49 
 
 		 1421 aa  550  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  39.49 
 
 		 684 aa  320  7e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4223  putative methylase/helicase  56.27 
 
 		 896 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.233912  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40550  predicted protein  33.96 
 
 		 950 aa  211  6e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30868  predicted protein  32.18 
 
 		 1487 aa  190  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186936  normal  0.423198 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  38.46 
 
 		 515 aa  171  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  46.24 
 
 		 397 aa  87.8  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  35.02 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  31.28 
 
 		 557 aa  62.4  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  31.34 
 
 		 2123 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  32.42 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  36.23 
 
 		 451 aa  56.6  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  32.42 
 
 		 449 aa  55.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  26.05 
 
 		 660 aa  55.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  37.23 
 
 		 658 aa  55.5  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4362  hypothetical protein  28.89 
 
 		 520 aa  52.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  23.69 
 
 		 481 aa  52  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  29.51 
 
 		 569 aa  50.8  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  23.34 
 
 		 481 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0003  helicase. putatve  21.82 
 
 		 2133 aa  50.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0073  DNA-methyltransferase-like  26.56 
 
 		 313 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.648628 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  29.17 
 
 		 481 aa  49.3  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  33.91 
 
 		 200 aa  48.5  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  29.68 
 
 		 187 aa  47.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  33.12 
 
 		 548 aa  47  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  25.99 
 
 		 505 aa  46.6  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  29.68 
 
 		 187 aa  46.2  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  24.65 
 
 		 477 aa  45.8  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1845  methyltransferase small  36.45 
 
 		 203 aa  46.2  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  29.03 
 
 		 187 aa  45.8  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  23.94 
 
 		 495 aa  45.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  27.54 
 
 		 860 aa  45.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1437  methyltransferase  35.83 
 
 		 203 aa  44.7  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>