48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4148 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  100 
 
 		 481 aa  982    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  39.52 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  37.87 
 
 		 450 aa  182  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3661  hypothetical protein  35.59 
 
 		 268 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2729  hypothetical protein  33.57 
 
 		 327 aa  123  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000436678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3689  hypothetical protein  34.72 
 
 		 268 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  37.84 
 
 		 557 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3129  hypothetical protein  28.52 
 
 		 282 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.03549  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03540  conserved hypothetical protein  30.26 
 
 		 281 aa  108  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03483  hypothetical protein  30.26 
 
 		 281 aa  108  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4966  hypothetical protein  32.85 
 
 		 267 aa  107  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5396  hypothetical protein  32.85 
 
 		 267 aa  107  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.613339  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1768  hypothetical protein  27.94 
 
 		 277 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000246433  hitchhiker  0.00548323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  35.65 
 
 		 254 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4673  hypothetical protein  31.92 
 
 		 289 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3416  hypothetical protein  29.77 
 
 		 281 aa  101  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2239  hypothetical protein  30.52 
 
 		 280 aa  100  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1409  hypothetical protein  30.19 
 
 		 280 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.180629 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0746  hypothetical protein  26.16 
 
 		 288 aa  99.8  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3215  hypothetical protein  30.19 
 
 		 288 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3355  hypothetical protein  29.3 
 
 		 280 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1380  hypothetical protein  28.1 
 
 		 277 aa  96.7  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.966548  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0478  hypothetical protein  27.44 
 
 		 277 aa  96.3  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 658 aa  94  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2891  hypothetical protein  27.68 
 
 		 277 aa  93.6  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.458702  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0060  hypothetical protein  29.06 
 
 		 282 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.218485  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0070  hypothetical protein  29.44 
 
 		 282 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000494627  decreased coverage  0.00000000181014 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  30.46 
 
 		 660 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1283  hypothetical protein  25.1 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  32.96 
 
 		 569 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0073  DNA-methyltransferase-like  32.62 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.648628 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  32.09 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02762  hypothetical protein  27.61 
 
 		 189 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02811  conserved hypothetical protein  27.61 
 
 		 189 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000331292  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4362  hypothetical protein  27.78 
 
 		 520 aa  67.8  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  31.36 
 
 		 187 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  28.12 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  30.51 
 
 		 187 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  30.86 
 
 		 548 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1886  hypothetical protein  22.73 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  34.9 
 
 		 1414 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5014  hypothetical protein  30.83 
 
 		 597 aa  51.2  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  29.31 
 
 		 1421 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  34.35 
 
 		 285 aa  49.3  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  33.57 
 
 		 251 aa  48.5  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  33.79 
 
 		 1425 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  28.8 
 
 		 836 aa  45.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  29.69 
 
 		 836 aa  43.9  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>