61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_E0032 on replicon NC_009790
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  98.4 
 
 
187 aa  378  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  96.79 
 
 
187 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  40.98 
 
 
569 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  43.2 
 
 
658 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0073  DNA-methyltransferase-like  41.67 
 
 
313 aa  90.5  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.648628 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  37.42 
 
 
660 aa  82  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  37.4 
 
 
557 aa  79.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  33.72 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  29.11 
 
 
449 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  29.11 
 
 
450 aa  68.6  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  30.12 
 
 
548 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4362  hypothetical protein  28.07 
 
 
520 aa  62.4  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5014  hypothetical protein  32.32 
 
 
597 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  30.51 
 
 
481 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  29.84 
 
 
451 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  31.06 
 
 
310 aa  58.2  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  30.77 
 
 
515 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  31.13 
 
 
684 aa  52.4  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  33.08 
 
 
1451 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  35.34 
 
 
1449 aa  51.2  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  35.29 
 
 
1444 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  31.25 
 
 
1412 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  32.33 
 
 
1448 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  32.65 
 
 
262 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  32.17 
 
 
1425 aa  49.3  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  29.49 
 
 
1440 aa  48.5  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  35.34 
 
 
1474 aa  48.5  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  33.81 
 
 
1447 aa  48.5  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  33.55 
 
 
1459 aa  47.8  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  29.55 
 
 
311 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  31.85 
 
 
1498 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  31.3 
 
 
1455 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  34.59 
 
 
1446 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  31.18 
 
 
249 aa  45.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  30.91 
 
 
1444 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  34.33 
 
 
1463 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  25.17 
 
 
527 aa  45.4  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0711  hypothetical protein  34.19 
 
 
188 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.025726 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  30.83 
 
 
1440 aa  45.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  32.88 
 
 
1396 aa  44.7  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1069  putative DNA methyltransferase  30.51 
 
 
205 aa  44.7  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  33.83 
 
 
1440 aa  44.7  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  29.29 
 
 
283 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  29.03 
 
 
836 aa  43.9  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0289  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.07 
 
 
281 aa  44.3  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  26.5 
 
 
269 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  26.5 
 
 
269 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  26.5 
 
 
269 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  26.5 
 
 
269 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3234  dimethyladenosine transferase  29.2 
 
 
287 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690544  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  26.5 
 
 
269 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  30.83 
 
 
489 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  26.76 
 
 
1536 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  26.5 
 
 
269 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  31.65 
 
 
1439 aa  41.6  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  31.65 
 
 
1439 aa  41.6  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  29.41 
 
 
836 aa  41.6  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0681  ribosomal RNA adenine methylase transferase  26.75 
 
 
202 aa  41.2  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  31.3 
 
 
200 aa  40.8  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  24.7 
 
 
269 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>