70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0058 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  383  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  98.4 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  98.4 
 
 		 187 aa  378  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  42.08 
 
 		 569 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  43.79 
 
 		 658 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0073  DNA-methyltransferase-like  42.5 
 
 		 313 aa  93.2  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.648628 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  37.82 
 
 		 660 aa  84.3  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  38.02 
 
 		 557 aa  80.9  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  33.52 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  29.11 
 
 		 449 aa  72  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 450 aa  70.9  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  30.12 
 
 		 548 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  31.36 
 
 		 481 aa  64.7  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  30.65 
 
 		 451 aa  63.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4362  hypothetical protein  28.65 
 
 		 520 aa  62  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5014  hypothetical protein  33.54 
 
 		 597 aa  61.6  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  31.06 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  33.08 
 
 		 1451 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  30.77 
 
 		 515 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  31.37 
 
 		 684 aa  52.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  36.03 
 
 		 1444 aa  52.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  35.34 
 
 		 1449 aa  52.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  31.25 
 
 		 1412 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1440 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  32.33 
 
 		 1448 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  32.17 
 
 		 1425 aa  49.3  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  32.65 
 
 		 262 aa  48.9  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  34.19 
 
 		 1459 aa  48.5  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  33.81 
 
 		 1447 aa  48.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  25.87 
 
 		 527 aa  48.1  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  35.34 
 
 		 1474 aa  47.8  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0711  hypothetical protein  34.19 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.025726 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1069  putative DNA methyltransferase  31.36 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  33.33 
 
 		 1463 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  29.55 
 
 		 311 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  32.85 
 
 		 1498 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  30.3 
 
 		 283 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  33.1 
 
 		 1396 aa  46.6  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  31.3 
 
 		 1455 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  34.59 
 
 		 1446 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  30.91 
 
 		 1444 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  27.35 
 
 		 269 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  27.35 
 
 		 269 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  29.68 
 
 		 836 aa  45.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  27.35 
 
 		 269 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  27.35 
 
 		 269 aa  45.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  27.35 
 
 		 269 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  27.35 
 
 		 269 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  31.18 
 
 		 249 aa  45.1  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3234  dimethyladenosine transferase  29.2 
 
 		 287 aa  45.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690544  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  30.83 
 
 		 1440 aa  44.7  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  33.83 
 
 		 1440 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  25.3 
 
 		 269 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  33.83 
 
 		 1726 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  30.2 
 
 		 836 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  31.82 
 
 		 1435 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0289  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 281 aa  42.4  0.004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  30.83 
 
 		 489 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  26.76 
 
 		 1536 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1572  hypothetical protein  33.77 
 
 		 193 aa  42  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0250932 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  26.5 
 
 		 269 aa  42  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0360  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.72 
 
 		 311 aa  41.6  0.007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.545999  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0681  ribosomal RNA adenine methylase transferase  26.75 
 
 		 202 aa  41.6  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3775  hypothetical protein  35.62 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651573 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  30.43 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  26.63 
 
 		 523 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 228 aa  41.2  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  31.65 
 
 		 1439 aa  40.8  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  31.65 
 
 		 1439 aa  40.8  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  29.55 
 
 		 240 aa  41.2  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>