53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7717 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  76.24 
 
 		 1444 aa  2204    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  76.03 
 
 		 1440 aa  2157    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  77.14 
 
 		 1440 aa  2212    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  79.39 
 
 		 1448 aa  2256    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  46.62 
 
 		 1414 aa  1141    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  45.9 
 
 		 1421 aa  1112    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  44.31 
 
 		 1425 aa  1033    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  74.54 
 
 		 1435 aa  2124    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  69.69 
 
 		 1437 aa  1931    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  60.71 
 
 		 1463 aa  1724    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  100 
 
 		 1474 aa  2966    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  44.29 
 
 		 1412 aa  990    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  78.13 
 
 		 1451 aa  2299    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  76.02 
 
 		 1439 aa  2180    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  76.02 
 
 		 1439 aa  2180    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  77.01 
 
 		 1440 aa  2199    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  80.16 
 
 		 1447 aa  2275    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  66.38 
 
 		 1396 aa  1832    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  92.56 
 
 		 1446 aa  2645    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  50.42 
 
 		 1440 aa  1339    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  66.62 
 
 		 1459 aa  1857    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  44.62 
 
 		 1413 aa  1050    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  72.13 
 
 		 1455 aa  2057    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  71.56 
 
 		 1459 aa  2069    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  57.63 
 
 		 1458 aa  1498    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  50.84 
 
 		 1529 aa  1458    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  62.8 
 
 		 1498 aa  1774    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4223  putative methylase/helicase  65.51 
 
 		 896 aa  1147    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.233912  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  52.09 
 
 		 1536 aa  1471    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  74.44 
 
 		 1444 aa  2138    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  77.58 
 
 		 1449 aa  2213    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  47 
 
 		 836 aa  609  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  47.08 
 
 		 836 aa  600  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  43.55 
 
 		 824 aa  579  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  51.36 
 
 		 684 aa  560  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  72.18 
 
 		 515 aa  552  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0437  putative methylase/helicase  45.82 
 
 		 611 aa  489  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3694  hypothetical protein  45.49 
 
 		 623 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4003  hypothetical protein  44.67 
 
 		 623 aa  421  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40550  predicted protein  35.21 
 
 		 950 aa  393  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30868  predicted protein  30.57 
 
 		 1487 aa  185  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186936  normal  0.423198 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  65.17 
 
 		 397 aa  131  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0597  helicase  65.57 
 
 		 137 aa  85.1  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  23.09 
 
 		 2123 aa  75.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0003  helicase. putatve  28.96 
 
 		 2133 aa  64.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  35.92 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  35.34 
 
 		 187 aa  54.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  35.34 
 
 		 187 aa  54.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  35.34 
 
 		 187 aa  52.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 658 aa  52  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  30.05 
 
 		 557 aa  50.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  28.91 
 
 		 660 aa  46.2  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  31.16 
 
 		 569 aa  46.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>