49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_3082 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  100 
 
 
515 aa  1022    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  75.25 
 
 
1451 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  75.32 
 
 
1447 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  71.82 
 
 
1449 aa  558  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  73.83 
 
 
1448 aa  545  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  70.85 
 
 
1446 aa  542  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  72.18 
 
 
1474 aa  538  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  67.39 
 
 
1444 aa  525  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  66.67 
 
 
1440 aa  514  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  65.4 
 
 
1444 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  68.32 
 
 
1440 aa  499  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  65.64 
 
 
1439 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  65.64 
 
 
1439 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  66.23 
 
 
1440 aa  489  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  59.09 
 
 
1435 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  61.22 
 
 
1455 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  61.27 
 
 
1459 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  58.54 
 
 
1437 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  53.43 
 
 
1498 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  57.95 
 
 
1396 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  54.19 
 
 
1459 aa  381  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  49.75 
 
 
1463 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  51.71 
 
 
684 aa  358  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  48.28 
 
 
1458 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  41.63 
 
 
1536 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  40.59 
 
 
1529 aa  293  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  41.46 
 
 
1440 aa  269  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  38.21 
 
 
1421 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  44.89 
 
 
1414 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  38.56 
 
 
836 aa  169  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  36.21 
 
 
836 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  33.41 
 
 
1425 aa  166  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  38.01 
 
 
824 aa  150  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  40.36 
 
 
1412 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  36.64 
 
 
1413 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  34.57 
 
 
254 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  27.8 
 
 
2123 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  30.22 
 
 
557 aa  61.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0003  helicase. putatve  27.78 
 
 
2133 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  30.77 
 
 
187 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  30.77 
 
 
187 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  30.77 
 
 
187 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  34.46 
 
 
658 aa  51.2  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4362  hypothetical protein  31.75 
 
 
520 aa  49.3  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  30.14 
 
 
569 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  32.03 
 
 
451 aa  48.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  29.92 
 
 
660 aa  44.3  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  29.32 
 
 
449 aa  44.3  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
450 aa  43.9  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>