73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3662 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  100 
 
 		 569 aa  1177    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  53.57 
 
 		 658 aa  316  6e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0031  hypothetical protein  47.44 
 
 		 453 aa  290  7e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0062  hypothetical protein  46.88 
 
 		 453 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0059  hypothetical protein  46.76 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322445 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0005  hypothetical protein  50.37 
 
 		 289 aa  243  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  42.08 
 
 		 187 aa  128  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  41.53 
 
 		 187 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  40.98 
 
 		 187 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  40.11 
 
 		 254 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  34.25 
 
 		 660 aa  101  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  37.65 
 
 		 557 aa  100  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0039  hypothetical protein  35.47 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4528  hypothetical protein  35.47 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103833  normal  0.57888 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  32.96 
 
 		 481 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  29.1 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4362  hypothetical protein  31.21 
 
 		 520 aa  75.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  34.33 
 
 		 1716 aa  75.1  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  34.33 
 
 		 1457 aa  74.3  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  33.58 
 
 		 1449 aa  72.4  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  33.91 
 
 		 451 aa  69.7  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  34.7 
 
 		 1414 aa  69.3  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6349  hypothetical protein  37.74 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  33.33 
 
 		 1412 aa  68.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  27.81 
 
 		 548 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0073  DNA-methyltransferase-like  33.81 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.648628 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  30.49 
 
 		 1458 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  31.9 
 
 		 1421 aa  61.2  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  32.9 
 
 		 1396 aa  61.2  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1425 aa  59.7  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  30 
 
 		 1459 aa  53.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  27.42 
 
 		 1463 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  32.08 
 
 		 554 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1773  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.89 
 
 		 265 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  26.06 
 
 		 1440 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  29.53 
 
 		 1529 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  28.7 
 
 		 1435 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  30.05 
 
 		 1498 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  30.14 
 
 		 515 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  29.53 
 
 		 389 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  23.47 
 
 		 585 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  28.74 
 
 		 1606 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  32.05 
 
 		 1642 aa  48.5  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  26 
 
 		 527 aa  48.5  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0211  N-6 DNA methylase  26.97 
 
 		 712 aa  48.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0759  dimethyladenosine transferase  33.01 
 
 		 243 aa  48.1  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  30.98 
 
 		 1440 aa  48.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  28.73 
 
 		 1444 aa  48.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  30.95 
 
 		 1649 aa  47.4  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  23.64 
 
 		 2274 aa  47  0.0009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  28.14 
 
 		 1575 aa  47  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  27.87 
 
 		 836 aa  45.8  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  25.59 
 
 		 860 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  30.28 
 
 		 574 aa  46.2  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  26.46 
 
 		 1447 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  30.28 
 
 		 574 aa  46.2  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  28.66 
 
 		 1455 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5014  hypothetical protein  29.89 
 
 		 597 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  28.41 
 
 		 1444 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  28.95 
 
 		 824 aa  45.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  28.99 
 
 		 684 aa  45.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  28.75 
 
 		 489 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  28.3 
 
 		 524 aa  45.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  30.07 
 
 		 1536 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  26.98 
 
 		 1449 aa  44.3  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2627  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  31.2 
 
 		 433 aa  44.3  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  26.71 
 
 		 410 aa  44.3  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2083  sun protein  27.46 
 
 		 437 aa  44.3  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  28.57 
 
 		 1448 aa  43.9  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  30.13 
 
 		 280 aa  43.5  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  29.36 
 
 		 574 aa  43.5  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0540  tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase  25.98 
 
 		 356 aa  43.5  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>