More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3794 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  75.86 
 
 		 585 aa  919    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  82.06 
 
 		 574 aa  995    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  81.43 
 
 		 587 aa  992    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  100 
 
 		 574 aa  1187    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  82.9 
 
 		 574 aa  1002    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  53.33 
 
 		 815 aa  583  1.0000000000000001e-165  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  57.47 
 
 		 505 aa  555  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  51.08 
 
 		 814 aa  555  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  50.54 
 
 		 816 aa  546  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  50.27 
 
 		 808 aa  546  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  48.19 
 
 		 822 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  54.18 
 
 		 495 aa  535  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  54.4 
 
 		 633 aa  528  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  54.26 
 
 		 908 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  48.95 
 
 		 891 aa  502  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  48.17 
 
 		 860 aa  501  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  53.89 
 
 		 508 aa  496  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  53.89 
 
 		 523 aa  496  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  49.17 
 
 		 824 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  53.26 
 
 		 873 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  46.11 
 
 		 568 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  47.93 
 
 		 495 aa  429  1e-119  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  44.4 
 
 		 523 aa  421  1e-116  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  44.93 
 
 		 494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  45.76 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  43.84 
 
 		 504 aa  392  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  43.29 
 
 		 505 aa  385  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  44.44 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  43.27 
 
 		 499 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  43.59 
 
 		 498 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  44.26 
 
 		 526 aa  371  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  42.89 
 
 		 496 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  37.89 
 
 		 810 aa  364  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  43.16 
 
 		 500 aa  361  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  40.43 
 
 		 508 aa  360  5e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  43.47 
 
 		 498 aa  359  7e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  43.89 
 
 		 499 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  41.52 
 
 		 526 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  41.77 
 
 		 506 aa  355  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  40.17 
 
 		 503 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  39.91 
 
 		 508 aa  350  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  37.54 
 
 		 809 aa  350  5e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  39.4 
 
 		 527 aa  349  7e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  40.97 
 
 		 505 aa  347  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  39.48 
 
 		 527 aa  345  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  40.33 
 
 		 493 aa  339  7e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  39.09 
 
 		 492 aa  339  7e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  37.93 
 
 		 847 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  38.6 
 
 		 810 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  36.09 
 
 		 799 aa  332  9e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  38.74 
 
 		 505 aa  332  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  38.29 
 
 		 808 aa  330  3e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  39.02 
 
 		 496 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  36.21 
 
 		 814 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  39.39 
 
 		 814 aa  329  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3427  type I restriction-modification system methylation subunit-like  39.91 
 
 		 504 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2925  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  39.96 
 
 		 708 aa  323  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  36.47 
 
 		 522 aa  323  6e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2210  N-6 DNA methylase  38.14 
 
 		 522 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  37.53 
 
 		 523 aa  318  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  37.78 
 
 		 527 aa  318  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  37.5 
 
 		 522 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  37.8 
 
 		 827 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  37.55 
 
 		 520 aa  310  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  37.55 
 
 		 520 aa  310  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  37 
 
 		 511 aa  308  3e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  35.94 
 
 		 871 aa  304  3.0000000000000004e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  35.52 
 
 		 516 aa  303  8.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  37.21 
 
 		 516 aa  301  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  34.83 
 
 		 544 aa  298  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  34.62 
 
 		 799 aa  296  8e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  36.53 
 
 		 513 aa  294  4e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0306  N-6 DNA methylase  35.18 
 
 		 547 aa  291  2e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  37.17 
 
 		 540 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2925  N-6 DNA methylase  37.8 
 
 		 680 aa  290  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4458  type I restriction-modification system, M subunit  33.75 
 
 		 863 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  36.61 
 
 		 564 aa  286  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  37.47 
 
 		 518 aa  286  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  37.47 
 
 		 518 aa  286  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4162  type I restriction-modification system, M subunit  34.7 
 
 		 874 aa  286  9e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.235487 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  34.56 
 
 		 525 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3672  type I restriction-modification system, M subunit  33.63 
 
 		 910 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  34.56 
 
 		 525 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01115  type I restriction-modification system, methyltransferase subunit  34.44 
 
 		 862 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  33.71 
 
 		 540 aa  284  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  35.36 
 
 		 532 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  36.75 
 
 		 540 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  37.27 
 
 		 518 aa  283  5.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  37.27 
 
 		 518 aa  283  5.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  34.46 
 
 		 541 aa  282  1e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  35.94 
 
 		 528 aa  282  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  34.64 
 
 		 510 aa  282  1e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  37.03 
 
 		 501 aa  281  2e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  36.25 
 
 		 511 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0333  N-6 DNA methylase  33.07 
 
 		 547 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175232 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  36.99 
 
 		 543 aa  280  5e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  36.81 
 
 		 501 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.64 
 
 		 549 aa  278  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4082  type I restriction-modification system, M subunit  33.39 
 
 		 863 aa  277  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  34.56 
 
 		 544 aa  276  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>