More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2765 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 		 410 aa  788    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6147  rRNA methyltransferase RsmB-like  90.49 
 
 		 421 aa  647    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2926  Fmu (Sun) domain-containing protein  85.12 
 
 		 422 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351382  normal  0.0315958 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0089  Fmu (Sun)  60.63 
 
 		 424 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2720  Fmu (Sun) domain-containing protein  62.77 
 
 		 535 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  59.44 
 
 		 443 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4040  Fmu (Sun)  54.72 
 
 		 410 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4779  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.58 
 
 		 426 aa  280  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.849075  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0038  sun protein  45.07 
 
 		 471 aa  275  9e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  42.11 
 
 		 450 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  42.11 
 
 		 450 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0031  Fmu (Sun) domain protein  41.71 
 
 		 450 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0156  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  41.38 
 
 		 450 aa  258  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0025  Fmu (Sun)  41.24 
 
 		 450 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0197  Fmu (Sun)  41.06 
 
 		 450 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0130363  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2924  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.75 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1089  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.8 
 
 		 453 aa  250  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0627  Fmu (Sun) domain protein  45.67 
 
 		 438 aa  248  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3660  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  43.13 
 
 		 438 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.469225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1747  sun protein  39.8 
 
 		 465 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1814  sun protein  39.55 
 
 		 465 aa  241  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.802421  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2963  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.11 
 
 		 447 aa  239  9e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270675  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2071  sun protein  41.3 
 
 		 463 aa  237  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1027  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.15 
 
 		 459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0325  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  39.45 
 
 		 450 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235081  normal  0.145888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1326  sun protein  42.92 
 
 		 440 aa  232  9e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1424  sun protein  40.84 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5220  sun protein  46.85 
 
 		 448 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02946  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1940  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.43 
 
 		 422 aa  227  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3096  Fmu (Sun)  44.5 
 
 		 419 aa  226  8e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4242  Fmu (Sun) domain protein  41.06 
 
 		 460 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3418  Fmu (Sun)  40.36 
 
 		 460 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2654  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.4 
 
 		 415 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4295  Sun protein  40.36 
 
 		 493 aa  223  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3917  Fmu (Sun) domain protein  39.08 
 
 		 462 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0687458  normal  0.615707 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0486  Fmu (Sun) domain protein  45.95 
 
 		 454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0522  Fmu (Sun) domain protein  45.45 
 
 		 438 aa  219  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0621766  normal  0.207218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0551  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.43 
 
 		 425 aa  219  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3191  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.04 
 
 		 470 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0072  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  34.83 
 
 		 456 aa  211  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000155418  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1047  Fmu (Sun)  39.57 
 
 		 437 aa  206  8e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.334338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  34.4 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  34.1 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  31.77 
 
 		 440 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2083  sun protein  35.33 
 
 		 437 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  35.55 
 
 		 429 aa  190  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  35.55 
 
 		 429 aa  190  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  35.55 
 
 		 435 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2646  hypothetical protein  32.28 
 
 		 427 aa  189  7e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  34.23 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2516  hypothetical protein  32.28 
 
 		 427 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  34.32 
 
 		 429 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  33.64 
 
 		 429 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  34.32 
 
 		 429 aa  186  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  34.32 
 
 		 429 aa  186  6e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  34.32 
 
 		 429 aa  186  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  34.32 
 
 		 429 aa  186  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  34.32 
 
 		 429 aa  186  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  34.32 
 
 		 429 aa  186  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  34.32 
 
 		 429 aa  186  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  34.32 
 
 		 429 aa  186  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  33.49 
 
 		 426 aa  186  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2271  sun protein  40.52 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558383 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  34.73 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0041  sun protein  33.87 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  34.02 
 
 		 429 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  34.02 
 
 		 429 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  33.79 
 
 		 429 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  35.73 
 
 		 429 aa  182  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  33.56 
 
 		 426 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  38.18 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  33.56 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  34.1 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  33.56 
 
 		 429 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2845  sun protein  36.59 
 
 		 431 aa  180  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.677129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0053  sun protein  40.98 
 
 		 437 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  33.03 
 
 		 425 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.74 
 
 		 427 aa  179  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  32.27 
 
 		 427 aa  178  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  32.97 
 
 		 452 aa  177  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  31.45 
 
 		 436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3583  sun protein  36.03 
 
 		 443 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0021  sun protein  31.04 
 
 		 437 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2626  sun protein  40.98 
 
 		 437 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00150  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  38.07 
 
 		 443 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  31.56 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  31.84 
 
 		 427 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  31.85 
 
 		 439 aa  170  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  31.8 
 
 		 428 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  30.75 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  30.66 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0039  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  32.23 
 
 		 462 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  30.58 
 
 		 427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  30.75 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  30.7 
 
 		 444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  30.75 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3674  sun protein  35.88 
 
 		 443 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0016  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  36.61 
 
 		 418 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.398476  normal  0.248834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0015  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  36.78 
 
 		 436 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0208773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  33.49 
 
 		 434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>