131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1615 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  100 
 
 		 1449 aa  2944    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  90.26 
 
 		 1716 aa  1513    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  94.72 
 
 		 1457 aa  2763    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6349  hypothetical protein  44.98 
 
 		 310 aa  235  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  40.65 
 
 		 1580 aa  197  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  39.48 
 
 		 986 aa  192  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  39.62 
 
 		 1448 aa  190  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  39.87 
 
 		 410 aa  188  6e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  39.3 
 
 		 1448 aa  187  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4528  hypothetical protein  37.8 
 
 		 442 aa  184  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103833  normal  0.57888 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  39.41 
 
 		 1495 aa  179  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0039  hypothetical protein  36.9 
 
 		 364 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  39.22 
 
 		 1077 aa  174  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  34.73 
 
 		 384 aa  168  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  36.77 
 
 		 285 aa  165  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  34.53 
 
 		 317 aa  163  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1305  hypothetical protein  53.94 
 
 		 394 aa  163  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.313037  hitchhiker  0.0000000978123 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  35.23 
 
 		 308 aa  160  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  159  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0237  hypothetical protein  54.6 
 
 		 179 aa  159  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  39.3 
 
 		 285 aa  157  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  34.23 
 
 		 317 aa  157  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  33.11 
 
 		 320 aa  156  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  33.11 
 
 		 320 aa  156  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  33.44 
 
 		 318 aa  155  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  33.96 
 
 		 318 aa  155  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  34.87 
 
 		 297 aa  154  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  37.5 
 
 		 313 aa  153  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  33.23 
 
 		 316 aa  153  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  33.54 
 
 		 315 aa  153  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  37.74 
 
 		 304 aa  152  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  150  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  31.76 
 
 		 320 aa  150  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  32.81 
 
 		 319 aa  149  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1616  hypothetical protein  49.4 
 
 		 398 aa  149  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.806109  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  33.33 
 
 		 299 aa  146  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  37.2 
 
 		 301 aa  146  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  34.82 
 
 		 338 aa  145  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  33.64 
 
 		 335 aa  145  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  33.83 
 
 		 323 aa  144  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  34.89 
 
 		 301 aa  142  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  34.93 
 
 		 284 aa  142  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  32.91 
 
 		 326 aa  141  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  32.69 
 
 		 295 aa  140  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  33.11 
 
 		 313 aa  139  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  32.09 
 
 		 300 aa  138  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  30.19 
 
 		 320 aa  137  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  33.11 
 
 		 321 aa  137  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  31.58 
 
 		 322 aa  136  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  31.17 
 
 		 328 aa  134  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0034  putative DNA replication primase  32.3 
 
 		 682 aa  133  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000123462  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  32.44 
 
 		 311 aa  133  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  32.1 
 
 		 344 aa  134  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  32.24 
 
 		 319 aa  133  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3226  domain of unknown function DUF1738  43.2 
 
 		 178 aa  133  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.60789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  32.5 
 
 		 312 aa  132  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  31.58 
 
 		 362 aa  132  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  32.65 
 
 		 314 aa  132  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  32.28 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  32.1 
 
 		 336 aa  130  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  32.78 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  31.83 
 
 		 322 aa  130  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  32.35 
 
 		 276 aa  130  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  35.04 
 
 		 248 aa  129  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  35.86 
 
 		 247 aa  129  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  32.47 
 
 		 327 aa  127  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  33.33 
 
 		 275 aa  127  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  29.78 
 
 		 319 aa  126  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  33.03 
 
 		 312 aa  125  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  31.79 
 
 		 308 aa  125  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  33.91 
 
 		 299 aa  125  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  34.11 
 
 		 288 aa  124  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6843  domain of unknown function DUF1738  31.45 
 
 		 296 aa  124  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal  0.17936 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  30.67 
 
 		 308 aa  124  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  31.29 
 
 		 304 aa  123  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  30.72 
 
 		 316 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  33.87 
 
 		 242 aa  122  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  31.56 
 
 		 333 aa  122  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  31.89 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  32.67 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  31.32 
 
 		 326 aa  119  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  31.32 
 
 		 326 aa  118  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  31.63 
 
 		 311 aa  118  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  30.74 
 
 		 308 aa  118  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  30.26 
 
 		 332 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  31.48 
 
 		 312 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  30.26 
 
 		 332 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  31.67 
 
 		 299 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4151  domain of unknown function DUF1738  30.03 
 
 		 296 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  33.69 
 
 		 316 aa  117  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  31.09 
 
 		 311 aa  117  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  29.93 
 
 		 332 aa  117  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  30.13 
 
 		 434 aa  116  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  30.23 
 
 		 320 aa  116  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  31.21 
 
 		 308 aa  116  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  31.39 
 
 		 310 aa  115  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  29.35 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  30.15 
 
 		 310 aa  112  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  27.67 
 
 		 297 aa  111  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  30.5 
 
 		 312 aa  111  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>