122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5558 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  100 
 
 		 338 aa  688    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  70.55 
 
 		 315 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  65.3 
 
 		 326 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  60.27 
 
 		 320 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  59.6 
 
 		 317 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  59.21 
 
 		 322 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  57.19 
 
 		 320 aa  363  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  57.19 
 
 		 320 aa  363  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  58.59 
 
 		 317 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  58.33 
 
 		 319 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  60.48 
 
 		 318 aa  357  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  61.54 
 
 		 316 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  59.86 
 
 		 321 aa  349  4e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  60.28 
 
 		 311 aa  346  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  55.85 
 
 		 313 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  55.1 
 
 		 318 aa  339  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  56.19 
 
 		 316 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  58.72 
 
 		 316 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  53 
 
 		 312 aa  289  6e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  58.8 
 
 		 247 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  58.51 
 
 		 248 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  44.44 
 
 		 321 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  42.3 
 
 		 308 aa  227  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  44.86 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  42.12 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  45.39 
 
 		 301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  44.78 
 
 		 304 aa  219  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  43.54 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  41.22 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2005  hypothetical protein  52.45 
 
 		 258 aa  216  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.146058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  38.26 
 
 		 328 aa  215  8e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  44.9 
 
 		 301 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  40.85 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  43.66 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  41.67 
 
 		 308 aa  212  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  42.91 
 
 		 308 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  40 
 
 		 332 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  40 
 
 		 332 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  39.65 
 
 		 332 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  42.09 
 
 		 299 aa  205  8e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  40.22 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  43.06 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  38.89 
 
 		 336 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  42.09 
 
 		 308 aa  203  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  38.41 
 
 		 333 aa  202  7e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  41.86 
 
 		 310 aa  202  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  41.64 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  41.84 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  38.34 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  39.43 
 
 		 319 aa  198  9e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  36.69 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  41.3 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  41.3 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  39.22 
 
 		 362 aa  196  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  37 
 
 		 335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  42.28 
 
 		 327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  38.68 
 
 		 326 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  38.68 
 
 		 326 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  36.34 
 
 		 384 aa  193  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  38.7 
 
 		 294 aa  192  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  40.67 
 
 		 308 aa  192  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  38.13 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  40.34 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  35.34 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  37.91 
 
 		 320 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  38.69 
 
 		 285 aa  186  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  45.8 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  35.31 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  37.79 
 
 		 312 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  40 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  37.25 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  38.11 
 
 		 410 aa  175  8e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  37.87 
 
 		 1448 aa  175  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  37.46 
 
 		 1448 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  38.16 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  39.46 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  35.91 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  38.21 
 
 		 1580 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4983  hypothetical protein  40.83 
 
 		 241 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  35.45 
 
 		 312 aa  169  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  37.93 
 
 		 320 aa  169  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  34.9 
 
 		 986 aa  169  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  35.41 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  38.77 
 
 		 311 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  36.63 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  34.93 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  34.68 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  36.45 
 
 		 1077 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  32.66 
 
 		 276 aa  155  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  32.79 
 
 		 319 aa  155  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5409  hypothetical protein  40.95 
 
 		 260 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal  0.17576 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  34.11 
 
 		 275 aa  152  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  35.31 
 
 		 1495 aa  151  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  34.47 
 
 		 1457 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  34.82 
 
 		 1449 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  34.45 
 
 		 280 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  31.46 
 
 		 297 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2408  domain of unknown function DUF1738  31.1 
 
 		 313 aa  137  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038447  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  35.83 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  34.16 
 
 		 1716 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>