113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5409 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5409  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  545  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal  0.17576 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  70.53 
 
 		 295 aa  318  5e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  69.42 
 
 		 285 aa  299  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  46.38 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  46.38 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  43.66 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  41.41 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  41.41 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  41.41 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  41.15 
 
 		 434 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  41.09 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  41.09 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  37.35 
 
 		 314 aa  162  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  44.12 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  41.18 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4983  hypothetical protein  41.87 
 
 		 241 aa  158  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  41.55 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  43.07 
 
 		 308 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  45.15 
 
 		 242 aa  156  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  41.09 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3267  hypothetical protein  37 
 
 		 341 aa  155  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  36.49 
 
 		 333 aa  155  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  40 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  41.4 
 
 		 310 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  40.67 
 
 		 338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  39.27 
 
 		 308 aa  151  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  39.35 
 
 		 308 aa  150  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  41.35 
 
 		 311 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  39.91 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  37.56 
 
 		 328 aa  145  8.000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  40.61 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  40.57 
 
 		 308 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  38.54 
 
 		 326 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2005  hypothetical protein  37.67 
 
 		 258 aa  142  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.146058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  39.13 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  39.42 
 
 		 306 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  38.94 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  40.62 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  39.53 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  38.05 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  39.32 
 
 		 306 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  39.41 
 
 		 362 aa  135  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  36.95 
 
 		 315 aa  135  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  40 
 
 		 319 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  37.98 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  37.74 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  37.07 
 
 		 322 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  40.38 
 
 		 320 aa  132  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  35.03 
 
 		 319 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  39.13 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  37.56 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  37.56 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  37.74 
 
 		 285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  38.46 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  39.32 
 
 		 318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  35.84 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  36.5 
 
 		 288 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1298  antirestriction protein-like  44.03 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  38.92 
 
 		 320 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  38.92 
 
 		 320 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  35.12 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  33.99 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  32.16 
 
 		 299 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  38.24 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  36.32 
 
 		 300 aa  125  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  36.82 
 
 		 321 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  34.41 
 
 		 336 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  37.61 
 
 		 327 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  32.52 
 
 		 323 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  35.48 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  34.94 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  34.96 
 
 		 316 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3508  hypothetical protein  34.38 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  37.44 
 
 		 316 aa  123  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  34.33 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  36.28 
 
 		 1580 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  34.65 
 
 		 320 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  34.38 
 
 		 312 aa  119  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  36.74 
 
 		 1448 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  36.74 
 
 		 1448 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  34.39 
 
 		 410 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  32.68 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  32.51 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  35.14 
 
 		 310 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  33.33 
 
 		 986 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5351  hypothetical protein  32.72 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.666575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  31.2 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  30.09 
 
 		 311 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  32.47 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  33.18 
 
 		 1495 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  29.09 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  33.83 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4265  antirestriction protein  35.9 
 
 		 169 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.963524  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  27.67 
 
 		 384 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  30.84 
 
 		 1077 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4151  domain of unknown function DUF1738  29.46 
 
 		 296 aa  97.1  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  31.55 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  32.55 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  32.06 
 
 		 1716 aa  92.8  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  38.75 
 
 		 325 aa  92.4  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>