124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4417 on replicon NC_011668
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  99.69 
 
 
326 aa  677    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  100 
 
 
326 aa  679    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  78.26 
 
 
434 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  78.26 
 
 
332 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  78.26 
 
 
332 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  78.57 
 
 
332 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  57.41 
 
 
321 aa  352  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  54.33 
 
 
328 aa  329  4e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  55.48 
 
 
314 aa  325  9e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  52.31 
 
 
333 aa  318  6e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  50.78 
 
 
319 aa  311  9e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  46.13 
 
 
285 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  42.68 
 
 
323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  45 
 
 
311 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  43.43 
 
 
312 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  43.21 
 
 
295 aa  225  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  38.7 
 
 
336 aa  220  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  44.69 
 
 
288 aa  219  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  40 
 
 
312 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  39.88 
 
 
344 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  42.76 
 
 
312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  39.25 
 
 
335 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  41.81 
 
 
317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  40.74 
 
 
320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  39.04 
 
 
326 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  38.21 
 
 
338 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  41.72 
 
 
299 aa  211  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  41.89 
 
 
304 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  43.05 
 
 
299 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  38.54 
 
 
322 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  41.78 
 
 
297 aa  209  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  41.46 
 
 
317 aa  208  9e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  40.28 
 
 
318 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  42.35 
 
 
284 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  39.51 
 
 
318 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  41.47 
 
 
301 aa  206  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  40.54 
 
 
308 aa  206  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  42.2 
 
 
285 aa  205  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  38.83 
 
 
315 aa  205  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  40.8 
 
 
410 aa  204  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  39.18 
 
 
320 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  38.74 
 
 
308 aa  203  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  38.36 
 
 
308 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  40.62 
 
 
316 aa  203  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  41.14 
 
 
301 aa  202  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  41.08 
 
 
986 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  40.64 
 
 
321 aa  202  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  39.3 
 
 
294 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  37.29 
 
 
300 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  39.27 
 
 
313 aa  198  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  38.93 
 
 
319 aa  198  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  39.56 
 
 
362 aa  198  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  37.21 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  38.82 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  37.75 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  42.23 
 
 
1580 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  40.27 
 
 
320 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  40.27 
 
 
320 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  36.96 
 
 
310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  39.6 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  41.89 
 
 
1448 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  41.89 
 
 
1448 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  37.67 
 
 
306 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  38.16 
 
 
299 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  38.16 
 
 
308 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  38.03 
 
 
308 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  37.5 
 
 
308 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  37.21 
 
 
306 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  36.21 
 
 
306 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  37.91 
 
 
300 aa  188  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  36.96 
 
 
1495 aa  186  5e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  37.37 
 
 
316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  37.11 
 
 
1077 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  36.5 
 
 
304 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  35.83 
 
 
311 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  35.64 
 
 
327 aa  182  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  36.75 
 
 
320 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  40 
 
 
311 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  36.3 
 
 
300 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  39.22 
 
 
313 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  41.74 
 
 
242 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4983  hypothetical protein  40.42 
 
 
241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  39.57 
 
 
247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5409  hypothetical protein  41.09 
 
 
260 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal  0.17576 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  35.03 
 
 
312 aa  162  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  33.77 
 
 
319 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  40 
 
 
248 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  35.56 
 
 
276 aa  156  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  33.9 
 
 
310 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  35.19 
 
 
280 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2408  domain of unknown function DUF1738  31.91 
 
 
313 aa  149  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038447  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  34.74 
 
 
275 aa  147  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  33.22 
 
 
297 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  34.8 
 
 
325 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2005  hypothetical protein  37.29 
 
 
258 aa  142  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.146058  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6843  domain of unknown function DUF1738  30.96 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal  0.17936 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  32.17 
 
 
297 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0034  putative DNA replication primase  33.8 
 
 
682 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000123462  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4151  domain of unknown function DUF1738  35.89 
 
 
296 aa  132  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  32.75 
 
 
660 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>