122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6561 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  100 
 
 
306 aa  633    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  92.48 
 
 
306 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  94.12 
 
 
306 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  93.46 
 
 
306 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  61.89 
 
 
308 aa  414  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  66.89 
 
 
308 aa  401  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  63 
 
 
310 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  65.33 
 
 
308 aa  387  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  62.54 
 
 
308 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  62.99 
 
 
308 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  61.24 
 
 
308 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4983  hypothetical protein  65.69 
 
 
241 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  55.52 
 
 
299 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  56.7 
 
 
301 aa  314  9e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  55.67 
 
 
299 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  51.66 
 
 
301 aa  290  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  50.17 
 
 
304 aa  288  7e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  57.5 
 
 
242 aa  276  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  47.1 
 
 
362 aa  267  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  45.08 
 
 
285 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  43.75 
 
 
294 aa  228  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  42.57 
 
 
318 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  41.5 
 
 
322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  40.74 
 
 
315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  44.53 
 
 
311 aa  215  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  41.16 
 
 
317 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  41.72 
 
 
316 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  41 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  42.66 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  41.16 
 
 
317 aa  212  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  43.69 
 
 
295 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  41.97 
 
 
311 aa  210  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  43.64 
 
 
314 aa  209  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  39.39 
 
 
328 aa  209  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  39.81 
 
 
312 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  43.58 
 
 
312 aa  208  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  40.66 
 
 
313 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  40.14 
 
 
326 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  40.4 
 
 
319 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  39.6 
 
 
300 aa  202  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  42.18 
 
 
338 aa  202  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  39.64 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  44.44 
 
 
308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  43.88 
 
 
321 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  40.71 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  43.59 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  38.02 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  40.65 
 
 
318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  36.84 
 
 
297 aa  195  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  39.67 
 
 
321 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  38.82 
 
 
320 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  38.82 
 
 
320 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  41.95 
 
 
316 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  39.8 
 
 
288 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  39.52 
 
 
332 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  39.52 
 
 
332 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  39.18 
 
 
332 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  39.52 
 
 
434 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  37.92 
 
 
326 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  37.92 
 
 
326 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  39.14 
 
 
304 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  38.16 
 
 
312 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  38.54 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  40.4 
 
 
300 aa  182  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  40.07 
 
 
310 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  41.02 
 
 
285 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  39.33 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  38.82 
 
 
312 aa  179  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  37.96 
 
 
344 aa  179  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  34.48 
 
 
323 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  39.66 
 
 
327 aa  179  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  37.46 
 
 
335 aa  176  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  40.32 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  39.66 
 
 
284 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  35.76 
 
 
299 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4227  antirestriction protein  54.61 
 
 
184 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0722776  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  34.52 
 
 
322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  42.98 
 
 
325 aa  165  6.9999999999999995e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  31.03 
 
 
384 aa  159  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  36.16 
 
 
311 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  34.93 
 
 
297 aa  155  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  39.27 
 
 
247 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  38.72 
 
 
248 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2005  hypothetical protein  42.44 
 
 
258 aa  142  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.146058  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  34.67 
 
 
280 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5409  hypothetical protein  38.94 
 
 
260 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal  0.17576 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  31.68 
 
 
986 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  32.48 
 
 
410 aa  140  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  32.81 
 
 
319 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  33.57 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0037  hypothetical protein  33.33 
 
 
287 aa  132  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  31.25 
 
 
1580 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  30.69 
 
 
297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0034  putative DNA replication primase  33.64 
 
 
682 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000123462  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  31.15 
 
 
1448 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6843  domain of unknown function DUF1738  31.27 
 
 
296 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal  0.17936 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  31.15 
 
 
1448 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2408  domain of unknown function DUF1738  32.15 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038447  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  31.86 
 
 
660 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  29.35 
 
 
1495 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>