121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1648 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  100 
 
 
410 aa  843    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  78.38 
 
 
1580 aa  488  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  77.36 
 
 
1448 aa  482  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  77.03 
 
 
1448 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  69.88 
 
 
1495 aa  456  1e-127  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  73.13 
 
 
986 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  65.65 
 
 
1077 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3508  hypothetical protein  48.57 
 
 
241 aa  200  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3267  hypothetical protein  48.57 
 
 
341 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  40.66 
 
 
285 aa  198  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  39.52 
 
 
311 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  41.02 
 
 
326 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  41.02 
 
 
326 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  42.14 
 
 
321 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  39.18 
 
 
332 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  39.18 
 
 
332 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  41.75 
 
 
314 aa  192  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  40.2 
 
 
1457 aa  192  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  38.83 
 
 
332 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  38.75 
 
 
1716 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  39.18 
 
 
434 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  36.05 
 
 
384 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  39.87 
 
 
1449 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  39.93 
 
 
312 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  36.91 
 
 
328 aa  187  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  39.53 
 
 
315 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  39.32 
 
 
285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  37.92 
 
 
295 aa  179  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  36.45 
 
 
308 aa  179  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  38.36 
 
 
320 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  35.58 
 
 
321 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  36.95 
 
 
333 aa  176  7e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  36.48 
 
 
318 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  37.07 
 
 
318 aa  176  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  38.69 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  37.21 
 
 
326 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  38.11 
 
 
338 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  36.6 
 
 
317 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  37.67 
 
 
320 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  37.67 
 
 
320 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  35.91 
 
 
319 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  38.19 
 
 
304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  35.06 
 
 
336 aa  173  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  34.42 
 
 
344 aa  173  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  36.16 
 
 
320 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  35.62 
 
 
323 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  37.8 
 
 
294 aa  169  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  35.37 
 
 
319 aa  169  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  35.16 
 
 
312 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  34.42 
 
 
335 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  37.97 
 
 
284 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  38.24 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  37.5 
 
 
316 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  36.24 
 
 
327 aa  167  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  35.62 
 
 
299 aa  166  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  34.47 
 
 
297 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  37.33 
 
 
316 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  36.3 
 
 
311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  36.3 
 
 
288 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  38.3 
 
 
300 aa  166  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  36.69 
 
 
313 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  36.04 
 
 
301 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  34.54 
 
 
317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  35.45 
 
 
322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4151  domain of unknown function DUF1738  34.92 
 
 
296 aa  162  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  37.13 
 
 
316 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  36.82 
 
 
362 aa  159  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  36.36 
 
 
301 aa  159  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  33.55 
 
 
322 aa  158  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  36.27 
 
 
308 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  36.71 
 
 
320 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  35.29 
 
 
313 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0034  putative DNA replication primase  33.44 
 
 
682 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000123462  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  36.49 
 
 
300 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  36.67 
 
 
308 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  34 
 
 
299 aa  150  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  35.33 
 
 
308 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  31.44 
 
 
319 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  32.69 
 
 
308 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  40 
 
 
242 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  37.19 
 
 
247 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  33.56 
 
 
299 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  33.45 
 
 
660 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  33.44 
 
 
310 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  39.26 
 
 
248 aa  142  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1646  hypothetical protein  66.67 
 
 
306 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  32.91 
 
 
306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2408  domain of unknown function DUF1738  33.55 
 
 
313 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038447  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  33.22 
 
 
308 aa  139  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  31.41 
 
 
312 aa  139  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1645  hypothetical protein  64.95 
 
 
357 aa  139  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  36.2 
 
 
300 aa  138  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  32.16 
 
 
308 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  32.67 
 
 
275 aa  136  9e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  32.48 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  29.64 
 
 
297 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  31.33 
 
 
310 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  32.15 
 
 
306 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  32.15 
 
 
306 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3504  antirestriction protein-like protein  72.09 
 
 
180 aa  132  9e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.519078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>