125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3793 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  613  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  74.48 
 
 		 299 aa  437  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  69.9 
 
 		 304 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  68.62 
 
 		 299 aa  418  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  70.93 
 
 		 301 aa  414  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  63.23 
 
 		 308 aa  371  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  61.43 
 
 		 308 aa  355  3.9999999999999996e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  56.36 
 
 		 308 aa  355  3.9999999999999996e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  57.09 
 
 		 362 aa  352  4e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  58.08 
 
 		 308 aa  338  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  56.04 
 
 		 306 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  55.33 
 
 		 310 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  57.73 
 
 		 308 aa  331  8e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  55.37 
 
 		 308 aa  326  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  65.95 
 
 		 242 aa  323  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  56.01 
 
 		 306 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  55.67 
 
 		 306 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  54.98 
 
 		 306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4983  hypothetical protein  59.05 
 
 		 241 aa  282  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  47.24 
 
 		 295 aa  249  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  49.13 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  48.44 
 
 		 317 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  46.53 
 
 		 294 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  46.23 
 
 		 285 aa  245  6.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  47.06 
 
 		 311 aa  244  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  47.08 
 
 		 311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  46.26 
 
 		 315 aa  241  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  45.78 
 
 		 316 aa  241  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  46.82 
 
 		 313 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  46.28 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  47.75 
 
 		 322 aa  236  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  45.67 
 
 		 320 aa  235  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  45.67 
 
 		 320 aa  235  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  45.67 
 
 		 320 aa  235  7e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  46.33 
 
 		 319 aa  235  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  45.86 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  44.86 
 
 		 318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  44.76 
 
 		 333 aa  233  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  46.44 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  48.28 
 
 		 316 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  44.15 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  47.51 
 
 		 316 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4227  antirestriction protein  69.54 
 
 		 184 aa  224  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0722776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  44.9 
 
 		 338 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  41.05 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  44.84 
 
 		 321 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  41.75 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  41.8 
 
 		 312 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  45.83 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  43.1 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  43.22 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  42.16 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  41.69 
 
 		 312 aa  212  5.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  43.24 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  40.6 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  40.51 
 
 		 320 aa  208  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  40 
 
 		 300 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  39.35 
 
 		 312 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  38.31 
 
 		 322 aa  203  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  40.22 
 
 		 332 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  40.22 
 
 		 332 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  40.22 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  42.86 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  40.94 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  40.94 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  42.96 
 
 		 300 aa  198  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  40.22 
 
 		 434 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  39.93 
 
 		 299 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  40.45 
 
 		 311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  43.45 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  44.48 
 
 		 285 aa  192  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  41.24 
 
 		 327 aa  192  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  36.6 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  36.93 
 
 		 344 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  40.62 
 
 		 320 aa  189  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  45.08 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  34.52 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  38.91 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  35.95 
 
 		 335 aa  185  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  41.5 
 
 		 284 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  37.13 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  43.44 
 
 		 247 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  33.33 
 
 		 986 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  36.04 
 
 		 410 aa  172  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  43.72 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  35.05 
 
 		 1495 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  34.67 
 
 		 1448 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  34.11 
 
 		 1077 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2404  antirestriction protein  65.49 
 
 		 125 aa  159  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.236455  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  38.24 
 
 		 319 aa  159  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  35.12 
 
 		 1580 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  34.33 
 
 		 1448 aa  158  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  35.05 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5409  hypothetical protein  40 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal  0.17576 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  36.52 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2408  domain of unknown function DUF1738  35.71 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038447  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  33.1 
 
 		 660 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  35.11 
 
 		 1457 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  34.93 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2005  hypothetical protein  42.38 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.146058  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>