122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4757 on replicon NC_009670
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  635    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  70.13 
 
 
308 aa  478  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  65.26 
 
 
310 aa  435  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  67.21 
 
 
308 aa  425  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  67.53 
 
 
308 aa  418  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  66.12 
 
 
306 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  64.61 
 
 
308 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  64.94 
 
 
308 aa  411  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  66.89 
 
 
306 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  65.8 
 
 
306 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  65.15 
 
 
306 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4983  hypothetical protein  71.97 
 
 
241 aa  378  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  59.45 
 
 
299 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  55 
 
 
299 aa  347  1e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  58.08 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  53.47 
 
 
304 aa  320  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  53.87 
 
 
301 aa  317  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  48.47 
 
 
362 aa  293  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  54.17 
 
 
242 aa  276  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  46.39 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  40.58 
 
 
322 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  42.86 
 
 
294 aa  227  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  40.58 
 
 
311 aa  227  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  44.16 
 
 
311 aa  226  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  44.9 
 
 
295 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  40.4 
 
 
315 aa  222  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  45.45 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  41.67 
 
 
338 aa  220  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  40.4 
 
 
317 aa  218  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  40.26 
 
 
320 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  40.26 
 
 
320 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  41.2 
 
 
316 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  40.38 
 
 
319 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  39.48 
 
 
321 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  40.07 
 
 
317 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  42.56 
 
 
333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  41.08 
 
 
316 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  42.96 
 
 
313 aa  211  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  39.93 
 
 
320 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  39.27 
 
 
318 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  39.26 
 
 
326 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  43.55 
 
 
314 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  42.76 
 
 
308 aa  210  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  43.86 
 
 
312 aa  209  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  39.18 
 
 
328 aa  208  7e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  39.4 
 
 
313 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  41.54 
 
 
316 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  38.57 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  38.95 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  40.19 
 
 
312 aa  199  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  39.8 
 
 
300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  41.26 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  41.26 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  40.91 
 
 
332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  39.17 
 
 
310 aa  195  7e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  41.26 
 
 
434 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  37.67 
 
 
297 aa  192  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  37.22 
 
 
312 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  38.41 
 
 
326 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  38.41 
 
 
326 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  40.52 
 
 
300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  36.61 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  37.42 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  40.33 
 
 
300 aa  183  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  38.05 
 
 
336 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  37.74 
 
 
335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  40 
 
 
285 aa  182  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  36.04 
 
 
312 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  35.87 
 
 
323 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  36.22 
 
 
320 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  39.8 
 
 
284 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  36.01 
 
 
299 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  38.87 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4227  antirestriction protein  55.19 
 
 
184 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0722776  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  34.78 
 
 
304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  39.34 
 
 
311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  37.41 
 
 
327 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  33.97 
 
 
322 aa  167  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  41.26 
 
 
248 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  40.36 
 
 
247 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  42.61 
 
 
325 aa  161  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  36.67 
 
 
410 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  34.3 
 
 
986 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5409  hypothetical protein  41.55 
 
 
260 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal  0.17576 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  31.58 
 
 
384 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  34.27 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  35.64 
 
 
280 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2005  hypothetical protein  40.78 
 
 
258 aa  149  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.146058  normal 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  34.48 
 
 
1077 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  32.31 
 
 
297 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  32.88 
 
 
1580 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  32.88 
 
 
1495 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  32 
 
 
1448 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  32.88 
 
 
1448 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  31.19 
 
 
319 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0037  hypothetical protein  33.93 
 
 
287 aa  132  9e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6843  domain of unknown function DUF1738  33.55 
 
 
296 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal  0.17936 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  31.41 
 
 
1457 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  31.6 
 
 
276 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  32.54 
 
 
275 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>