112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2005 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2005  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  521  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.146058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  64.88 
 
 		 320 aa  265  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  63.37 
 
 		 318 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  64.04 
 
 		 316 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  63.55 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  61.58 
 
 		 317 aa  255  5e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  62.75 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  62.25 
 
 		 317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  60.7 
 
 		 311 aa  252  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  59.61 
 
 		 318 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  61.27 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  61.08 
 
 		 320 aa  248  7e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  61.08 
 
 		 320 aa  248  7e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  62.07 
 
 		 319 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  63.05 
 
 		 316 aa  241  6e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  58.42 
 
 		 321 aa  241  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  62.56 
 
 		 313 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  54.63 
 
 		 315 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  63.24 
 
 		 316 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  50.43 
 
 		 326 aa  216  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  52.45 
 
 		 338 aa  216  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  56.16 
 
 		 312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  42.16 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  43.2 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  42.38 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  40.67 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  41.35 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  37.56 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  37.17 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  42.23 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  40.76 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  40.39 
 
 		 288 aa  141  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  42.79 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  38.39 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  37.61 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  42.72 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4983  hypothetical protein  38.83 
 
 		 241 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  41.67 
 
 		 306 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  39.02 
 
 		 326 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  39.02 
 
 		 326 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  40.98 
 
 		 306 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  39.9 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  37 
 
 		 344 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  40.38 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  37.44 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  37.44 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  37.44 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  37.44 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  39.35 
 
 		 308 aa  136  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5409  hypothetical protein  37.09 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal  0.17576 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  40.69 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  37.67 
 
 		 310 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  37.74 
 
 		 312 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  37.91 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  37.07 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  36.09 
 
 		 335 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  38.05 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  37.85 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  38.65 
 
 		 362 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  38.65 
 
 		 294 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  37.79 
 
 		 323 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  34.55 
 
 		 322 aa  123  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  36.1 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  39.9 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  36.1 
 
 		 285 aa  121  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  36.84 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  36.49 
 
 		 312 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  36.36 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  36.27 
 
 		 300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5351  hypothetical protein  39.81 
 
 		 220 aa  118  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.666575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  33.79 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  37.68 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3267  hypothetical protein  35.94 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3508  hypothetical protein  35.56 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  37.14 
 
 		 284 aa  112  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  36.49 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  36.41 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4265  antirestriction protein  35.54 
 
 		 169 aa  110  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.963524  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  37.26 
 
 		 327 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  36.11 
 
 		 410 aa  108  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  35.11 
 
 		 319 aa  108  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  37.07 
 
 		 285 aa  105  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  36.11 
 
 		 1448 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  35.05 
 
 		 986 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  38.03 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  31.53 
 
 		 304 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  35.78 
 
 		 1580 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  31.2 
 
 		 384 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  33.81 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  36.11 
 
 		 1448 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  34.88 
 
 		 312 aa  102  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  35.47 
 
 		 320 aa  99.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  35.21 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1298  antirestriction protein-like  36.36 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1077 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  32.43 
 
 		 280 aa  95.5  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  31.98 
 
 		 276 aa  93.2  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  30.32 
 
 		 660 aa  89.4  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  31.84 
 
 		 275 aa  85.9  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1495 aa  85.5  8e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>