122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6816 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  100 
 
 		 306 aa  630  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  95.1 
 
 		 306 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  94.12 
 
 		 306 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  94.77 
 
 		 306 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  61.56 
 
 		 308 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  65.8 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  63 
 
 		 310 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  62.87 
 
 		 308 aa  384  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  63.4 
 
 		 308 aa  381  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  65.33 
 
 		 308 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  60.87 
 
 		 308 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4983  hypothetical protein  64.85 
 
 		 241 aa  333  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  56.01 
 
 		 299 aa  333  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  57.04 
 
 		 301 aa  318  9e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  55.33 
 
 		 299 aa  317  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  50.49 
 
 		 304 aa  293  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  51.99 
 
 		 301 aa  293  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  57.92 
 
 		 242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  47.78 
 
 		 362 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  44.67 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  45.08 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  42.91 
 
 		 318 aa  215  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  41.78 
 
 		 322 aa  211  9e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  42.39 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  44.53 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  43.34 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  41 
 
 		 320 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  40.67 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  40.51 
 
 		 317 aa  206  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  43.92 
 
 		 312 aa  207  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  41.97 
 
 		 311 aa  205  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  41.61 
 
 		 333 aa  205  9e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  40.51 
 
 		 317 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  43.25 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  38.72 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  41.42 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  39.64 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  42.18 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  44.96 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  38.49 
 
 		 312 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  37.83 
 
 		 297 aa  199  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  39.55 
 
 		 319 aa  198  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  43.96 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  39.8 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  39.27 
 
 		 300 aa  195  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  42.28 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  44.11 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  39.68 
 
 		 321 aa  192  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  39.47 
 
 		 320 aa  191  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  39.47 
 
 		 320 aa  191  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  38.02 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  39.35 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  38.36 
 
 		 288 aa  189  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  39.1 
 
 		 318 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  38.7 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  38.7 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  38.36 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  38.7 
 
 		 434 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  37.46 
 
 		 326 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  37.46 
 
 		 326 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  39.8 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  38.73 
 
 		 336 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  40.4 
 
 		 310 aa  178  8e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  39.67 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  38.16 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  39.14 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  40.96 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  38.58 
 
 		 344 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  37.09 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  39.33 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  33.96 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  38.1 
 
 		 335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  39.34 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  40.07 
 
 		 284 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  44.63 
 
 		 325 aa  169  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  35.54 
 
 		 299 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  34.29 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4227  antirestriction protein  51.9 
 
 		 184 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0722776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  36.84 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  31.03 
 
 		 384 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  34.35 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  38.8 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5409  hypothetical protein  39.42 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal  0.17576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  39.15 
 
 		 248 aa  142  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2005  hypothetical protein  41.75 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.146058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  31.77 
 
 		 986 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  32.15 
 
 		 410 aa  138  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  33.45 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  32.75 
 
 		 276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  30.41 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  31.7 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1580 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0034  putative DNA replication primase  33.33 
 
 		 682 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000123462  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  32.09 
 
 		 1077 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  32.17 
 
 		 660 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1448 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0037  hypothetical protein  31.85 
 
 		 287 aa  125  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  30.82 
 
 		 1448 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1298  antirestriction protein-like  44.38 
 
 		 199 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2408  domain of unknown function DUF1738  32.46 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>