111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1298 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1298  antirestriction protein-like  100 
 
 
199 aa  416  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430791  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  86.21 
 
 
294 aa  319  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  92.59 
 
 
325 aa  209  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  50.92 
 
 
299 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  42.49 
 
 
295 aa  144  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  44.38 
 
 
304 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  44.05 
 
 
301 aa  139  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  39.69 
 
 
285 aa  133  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  42.86 
 
 
301 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  43.62 
 
 
308 aa  132  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  43.37 
 
 
308 aa  131  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  43.27 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5409  hypothetical protein  44.03 
 
 
260 aa  128  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal  0.17576 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4983  hypothetical protein  43.98 
 
 
241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  45.06 
 
 
242 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  42.17 
 
 
362 aa  124  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  41.82 
 
 
308 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  41.34 
 
 
310 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  40.91 
 
 
299 aa  122  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  39.05 
 
 
321 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  42.01 
 
 
306 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  43.79 
 
 
306 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  39.16 
 
 
308 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  42.2 
 
 
312 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  42.01 
 
 
306 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  38.1 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  42.6 
 
 
306 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  38.24 
 
 
315 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  42.37 
 
 
313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  39.05 
 
 
338 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  37.22 
 
 
312 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  35.67 
 
 
332 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  35.67 
 
 
332 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  35.67 
 
 
332 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  37.65 
 
 
314 aa  111  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  41.18 
 
 
310 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  35.67 
 
 
434 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  35.36 
 
 
326 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  33.66 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  35.75 
 
 
316 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  39.63 
 
 
311 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  35.75 
 
 
317 aa  105  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  35.91 
 
 
316 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  36 
 
 
317 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  35.23 
 
 
320 aa  101  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  35.09 
 
 
312 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  29.85 
 
 
319 aa  99.4  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  38.93 
 
 
311 aa  99  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  34.12 
 
 
299 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  29.35 
 
 
328 aa  98.6  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  33.51 
 
 
288 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  32.12 
 
 
336 aa  97.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2005  hypothetical protein  36.36 
 
 
258 aa  97.1  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.146058  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  38.3 
 
 
300 aa  96.7  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  35.92 
 
 
322 aa  96.3  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  34.66 
 
 
247 aa  95.9  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  34.64 
 
 
312 aa  95.9  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  35.33 
 
 
320 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  32.61 
 
 
322 aa  95.5  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  34.07 
 
 
319 aa  94.4  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  30.93 
 
 
344 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  33.15 
 
 
326 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  33.15 
 
 
326 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  32.95 
 
 
248 aa  92.8  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  33.94 
 
 
285 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  33.52 
 
 
313 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  32.77 
 
 
318 aa  92  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  38.3 
 
 
300 aa  92  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  33.71 
 
 
321 aa  91.7  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  33.14 
 
 
318 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  35.92 
 
 
323 aa  90.5  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  39.38 
 
 
284 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5351  hypothetical protein  37.31 
 
 
220 aa  89.4  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.666575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  30.05 
 
 
335 aa  89  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  34.09 
 
 
320 aa  88.2  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  34.09 
 
 
320 aa  88.2  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  33.52 
 
 
316 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  35.14 
 
 
300 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  37.19 
 
 
297 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  36.03 
 
 
304 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  36.9 
 
 
327 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  34.03 
 
 
1077 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  37.71 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  38.62 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  38.76 
 
 
297 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  44.21 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  32.98 
 
 
1448 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  32.98 
 
 
1448 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4265  antirestriction protein  43.16 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.963524  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  29.73 
 
 
986 aa  75.1  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  32.45 
 
 
1580 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6843  domain of unknown function DUF1738  35.34 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal  0.17936 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  31.75 
 
 
410 aa  71.6  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  37.4 
 
 
276 aa  71.6  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  29.17 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3508  hypothetical protein  35.21 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  30.82 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3267  hypothetical protein  35.21 
 
 
341 aa  68.9  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  34.15 
 
 
280 aa  65.1  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  29.63 
 
 
1495 aa  63.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>