114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3267 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3267  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  700    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3508  hypothetical protein  97.01 
 
 		 241 aa  472  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  50.72 
 
 		 1448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  51.2 
 
 		 1580 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  50.72 
 
 		 1448 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  48.57 
 
 		 410 aa  199  7.999999999999999e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  47.39 
 
 		 986 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  45.12 
 
 		 1077 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  45.24 
 
 		 1495 aa  177  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5409  hypothetical protein  37 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal  0.17576 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  40.09 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  37.16 
 
 		 312 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  35.45 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  32 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  36.65 
 
 		 312 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  34.7 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  34.54 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  36.41 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  30.8 
 
 		 344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  36.97 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  38.39 
 
 		 285 aa  119  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  30.8 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  33.73 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  37.26 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  37.26 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  37.67 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  33.96 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  33.96 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  33.96 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  36.45 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  39.51 
 
 		 1716 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  33.96 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  31.31 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  37.21 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2005  hypothetical protein  35.94 
 
 		 258 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.146058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  36.87 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  33.64 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  30.88 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  34.22 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  35.65 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4151  domain of unknown function DUF1738  34.3 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  33.49 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  30.77 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  32.72 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  33.78 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  34.8 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4983  hypothetical protein  31.65 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  36.54 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  32.72 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  35.81 
 
 		 1457 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  32.43 
 
 		 297 aa  99.8  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  32.13 
 
 		 308 aa  99.4  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  33.18 
 
 		 242 aa  99.4  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  29.77 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  35.35 
 
 		 1449 aa  97.8  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  34.5 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  33.94 
 
 		 321 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  31.73 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  33.94 
 
 		 299 aa  96.7  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  33.01 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  32.86 
 
 		 317 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  30.59 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  34.29 
 
 		 300 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  32.7 
 
 		 320 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  30.83 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  30.83 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  32.54 
 
 		 247 aa  93.6  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  32.54 
 
 		 322 aa  93.2  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  31.47 
 
 		 308 aa  93.2  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  32.06 
 
 		 248 aa  93.2  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  33.94 
 
 		 311 aa  92.8  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  34.62 
 
 		 320 aa  92.4  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  32.21 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  30.41 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  32.93 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  30.81 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5351  hypothetical protein  33.18 
 
 		 220 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.666575 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  31.92 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  32.71 
 
 		 327 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4265  antirestriction protein  33.52 
 
 		 169 aa  90.1  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.963524  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  30.97 
 
 		 362 aa  89.7  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  30.05 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  31.16 
 
 		 300 aa  87.8  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  33.02 
 
 		 288 aa  87  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  30.8 
 
 		 312 aa  86.7  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  32.06 
 
 		 319 aa  85.9  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  30.92 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  27.85 
 
 		 660 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  30.49 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  33.48 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0034  putative DNA replication primase  26.4 
 
 		 682 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000123462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  29.63 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  28.31 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  28.24 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  31.46 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  27.31 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  27.31 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  30.92 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  27.75 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  26.85 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>