122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0255 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  100 
 
 		 299 aa  620  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  71.38 
 
 		 299 aa  418  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  66.67 
 
 		 304 aa  397  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  68.62 
 
 		 301 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  66.56 
 
 		 301 aa  384  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  57.67 
 
 		 308 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  59.67 
 
 		 308 aa  358  8e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  58.33 
 
 		 308 aa  348  5e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  57.14 
 
 		 362 aa  340  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  56.36 
 
 		 306 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  68.97 
 
 		 242 aa  333  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  55 
 
 		 308 aa  332  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  55.52 
 
 		 306 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  55.67 
 
 		 308 aa  323  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  55.33 
 
 		 308 aa  322  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  56.01 
 
 		 306 aa  322  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  55.67 
 
 		 306 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  51.67 
 
 		 310 aa  315  6e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4983  hypothetical protein  55.41 
 
 		 241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  50.72 
 
 		 311 aa  265  8e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  47.04 
 
 		 285 aa  251  9.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  47.57 
 
 		 311 aa  250  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  49.48 
 
 		 294 aa  248  6e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  48.24 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  49.32 
 
 		 308 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  47.59 
 
 		 295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  45.52 
 
 		 333 aa  239  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  43.54 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  43.05 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  44.33 
 
 		 315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  42.38 
 
 		 317 aa  235  7e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  43.73 
 
 		 319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  42.32 
 
 		 316 aa  232  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  43.43 
 
 		 321 aa  229  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  43.39 
 
 		 320 aa  229  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  43.39 
 
 		 320 aa  229  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  42.76 
 
 		 326 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  41.22 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  43.54 
 
 		 318 aa  225  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  40.26 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  45.05 
 
 		 316 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  45.14 
 
 		 312 aa  222  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  43.77 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  42.47 
 
 		 300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  42.05 
 
 		 312 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  39.58 
 
 		 328 aa  219  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  43.54 
 
 		 338 aa  217  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  43.38 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  42.8 
 
 		 332 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  42.8 
 
 		 332 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  41.2 
 
 		 299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  42.8 
 
 		 332 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  42.76 
 
 		 288 aa  215  7e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  43.07 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  41.36 
 
 		 313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  42.8 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  40.53 
 
 		 312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4227  antirestriction protein  65.36 
 
 		 184 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0722776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  42.28 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  39.67 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  42.62 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  38.65 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  42.32 
 
 		 327 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  42.81 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  42.86 
 
 		 320 aa  202  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  40.97 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  40.97 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  39.23 
 
 		 320 aa  198  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  40.21 
 
 		 310 aa  198  9e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  42.71 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  39.59 
 
 		 312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  37.89 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  39.67 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  35.46 
 
 		 323 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  37.73 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  36.56 
 
 		 322 aa  189  5e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  37.58 
 
 		 344 aa  189  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  40.73 
 
 		 284 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  38.87 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  47.92 
 
 		 325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  42.19 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  40.85 
 
 		 248 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  36.9 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  35.62 
 
 		 410 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  35.41 
 
 		 986 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  36.7 
 
 		 1077 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  35.37 
 
 		 1495 aa  161  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5409  hypothetical protein  44.12 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal  0.17576 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  36.3 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1580 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  35.97 
 
 		 1448 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  35.97 
 
 		 1448 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6843  domain of unknown function DUF1738  36.24 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal  0.17936 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  36.79 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2404  antirestriction protein  63.64 
 
 		 125 aa  153  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.236455  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  30.61 
 
 		 297 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  34.36 
 
 		 280 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  32.31 
 
 		 660 aa  152  8e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2408  domain of unknown function DUF1738  34.64 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038447  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  33.97 
 
 		 1457 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>