124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4029 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  100 
 
 		 301 aa  621  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  86.73 
 
 		 304 aa  520  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  70.93 
 
 		 301 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  70.03 
 
 		 299 aa  418  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  66.56 
 
 		 299 aa  408  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  55.89 
 
 		 308 aa  352  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  55.82 
 
 		 362 aa  344  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  57.48 
 
 		 308 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  55.74 
 
 		 308 aa  330  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  53.87 
 
 		 308 aa  325  6e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  54.42 
 
 		 308 aa  319  3.9999999999999996e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  64.22 
 
 		 242 aa  316  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  51.7 
 
 		 310 aa  314  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  51.82 
 
 		 306 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  53.04 
 
 		 308 aa  306  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  51.66 
 
 		 306 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  51.32 
 
 		 306 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  51.82 
 
 		 306 aa  295  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  49.83 
 
 		 285 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4983  hypothetical protein  54.7 
 
 		 241 aa  269  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  49.83 
 
 		 295 aa  263  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  48.16 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  45.25 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  46.08 
 
 		 311 aa  245  8e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  46 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  47.62 
 
 		 321 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  46.84 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  47.49 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  42.16 
 
 		 318 aa  237  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  45.39 
 
 		 338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  44.19 
 
 		 321 aa  229  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  42.81 
 
 		 316 aa  229  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  45.36 
 
 		 314 aa  227  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  42.27 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  43.96 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  42.33 
 
 		 317 aa  223  4e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  42.95 
 
 		 316 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  43.24 
 
 		 320 aa  222  7e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  43.24 
 
 		 320 aa  222  7e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  44.88 
 
 		 316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  43.71 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  39.87 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  42.57 
 
 		 319 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  41.69 
 
 		 317 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  43.88 
 
 		 318 aa  220  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  44.37 
 
 		 327 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  41.92 
 
 		 312 aa  218  7e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  42.09 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  42.91 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  41.33 
 
 		 332 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  41.33 
 
 		 332 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  42.05 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  41.33 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  43.94 
 
 		 312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  40.96 
 
 		 326 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  40.94 
 
 		 434 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  43.89 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  40.26 
 
 		 312 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  41.53 
 
 		 312 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  38.25 
 
 		 328 aa  209  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  41.47 
 
 		 326 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  41.47 
 
 		 326 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4227  antirestriction protein  64.9 
 
 		 184 aa  209  7e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0722776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  41.81 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  40.74 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  39.61 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  40.85 
 
 		 299 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  44.15 
 
 		 300 aa  203  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  40 
 
 		 320 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  38.46 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  39.81 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  37.34 
 
 		 323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  37.9 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  37.82 
 
 		 344 aa  195  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  37.58 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  41.58 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  38.16 
 
 		 297 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  41.52 
 
 		 320 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  39.74 
 
 		 284 aa  182  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5409  hypothetical protein  46.38 
 
 		 260 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal  0.17576 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  35.64 
 
 		 986 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  43.75 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  37.38 
 
 		 1495 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  34.71 
 
 		 384 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  36.69 
 
 		 410 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  36.54 
 
 		 1580 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  36.27 
 
 		 1448 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  36.88 
 
 		 1448 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  35.08 
 
 		 1077 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  41.53 
 
 		 247 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  37.41 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  32.65 
 
 		 297 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  39.15 
 
 		 248 aa  159  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  37 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2404  antirestriction protein  62.83 
 
 		 125 aa  157  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.236455  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  37.54 
 
 		 1457 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  37.22 
 
 		 1449 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  34.38 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  34.62 
 
 		 275 aa  148  8e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  32.64 
 
 		 660 aa  146  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>