117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0639 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  577  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  57.25 
 
 
275 aa  349  4e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  45.1 
 
 
297 aa  246  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  40.22 
 
 
280 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6843  domain of unknown function DUF1738  38.79 
 
 
296 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal  0.17936 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  42.55 
 
 
660 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  35.33 
 
 
319 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  38.43 
 
 
332 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  38.43 
 
 
332 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  38.08 
 
 
332 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  35.54 
 
 
328 aa  168  7e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  38.08 
 
 
434 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  34.77 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  36.79 
 
 
333 aa  162  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  34.48 
 
 
326 aa  161  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  36.3 
 
 
299 aa  159  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  37.59 
 
 
321 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  32.66 
 
 
338 aa  155  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  37.5 
 
 
312 aa  155  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  34.95 
 
 
321 aa  155  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  34.69 
 
 
317 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  33.33 
 
 
311 aa  152  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  34 
 
 
320 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2408  domain of unknown function DUF1738  30.46 
 
 
313 aa  148  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038447  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  34.53 
 
 
322 aa  148  8e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  34.36 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  34.93 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  35.56 
 
 
326 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  35.56 
 
 
326 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  33.68 
 
 
315 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  31.08 
 
 
285 aa  145  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  32.64 
 
 
318 aa  145  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  34.11 
 
 
320 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  32.53 
 
 
362 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  34.64 
 
 
314 aa  143  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  32.07 
 
 
316 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  32.07 
 
 
320 aa  142  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  32.07 
 
 
320 aa  142  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  32.29 
 
 
319 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  34.75 
 
 
294 aa  142  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  32.18 
 
 
1580 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  31.49 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  32.18 
 
 
300 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  34.93 
 
 
301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  32.07 
 
 
295 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  32.07 
 
 
1448 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  32.07 
 
 
1448 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  34.38 
 
 
301 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  30.87 
 
 
312 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  31.15 
 
 
323 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  31.62 
 
 
312 aa  135  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  32.63 
 
 
320 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  31.13 
 
 
1077 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  32.18 
 
 
297 aa  133  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  29.93 
 
 
335 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  33.92 
 
 
306 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  32.08 
 
 
410 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  31.96 
 
 
986 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  30.88 
 
 
308 aa  132  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  31.01 
 
 
297 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  31.83 
 
 
310 aa  132  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  32.68 
 
 
1457 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  30.87 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  32.53 
 
 
299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  32.52 
 
 
306 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  32.35 
 
 
1449 aa  129  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  31.19 
 
 
313 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  29.61 
 
 
344 aa  128  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  28.95 
 
 
336 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  29.67 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  33.89 
 
 
299 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  32.32 
 
 
1495 aa  125  5e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  31.69 
 
 
306 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  32.33 
 
 
308 aa  125  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  29.32 
 
 
311 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  30.85 
 
 
310 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  31.47 
 
 
306 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  32.38 
 
 
288 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  32.64 
 
 
308 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  30.1 
 
 
308 aa  122  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4151  domain of unknown function DUF1738  32.98 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  34.72 
 
 
313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  33.11 
 
 
316 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  31.8 
 
 
1716 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  32.27 
 
 
284 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  29.27 
 
 
304 aa  115  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  31.6 
 
 
308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  31.91 
 
 
300 aa  115  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  31.34 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  31.53 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  30.74 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  32.13 
 
 
311 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  33.48 
 
 
248 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  32.37 
 
 
285 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  32.09 
 
 
316 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  31.33 
 
 
247 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  33.91 
 
 
242 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  28.37 
 
 
327 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0034  putative DNA replication primase  30.45 
 
 
682 aa  99.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000123462  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4227  antirestriction protein  40.8 
 
 
184 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0722776  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>