123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9564 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  100 
 
 		 308 aa  641    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  70.13 
 
 		 308 aa  461  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  65.58 
 
 		 310 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  68.18 
 
 		 308 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  65.58 
 
 		 308 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  64.29 
 
 		 308 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  65.26 
 
 		 308 aa  415  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  61.56 
 
 		 306 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  61.89 
 
 		 306 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  61.56 
 
 		 306 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  60.91 
 
 		 306 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4983  hypothetical protein  71.13 
 
 		 241 aa  377  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  57.67 
 
 		 299 aa  365  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  55.67 
 
 		 299 aa  343  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  56.36 
 
 		 301 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  54.28 
 
 		 304 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  55.89 
 
 		 301 aa  328  6e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  49.83 
 
 		 362 aa  295  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  55.42 
 
 		 242 aa  291  8e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  46.05 
 
 		 285 aa  245  8e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  42.81 
 
 		 315 aa  242  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  45.12 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  47.81 
 
 		 311 aa  238  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  43.99 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  43.67 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  41.45 
 
 		 294 aa  227  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  42.43 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  42.42 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  40.71 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  42.3 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  42.86 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  41.56 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  43.05 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  41.18 
 
 		 320 aa  222  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  41.18 
 
 		 320 aa  222  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  41.23 
 
 		 317 aa  221  8e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  42.31 
 
 		 316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  40.7 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  42.9 
 
 		 321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  41.72 
 
 		 300 aa  218  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  43.45 
 
 		 316 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  42.03 
 
 		 316 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  41.72 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  43.1 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  42.18 
 
 		 318 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  42.4 
 
 		 313 aa  209  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  40.36 
 
 		 319 aa  208  8e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  42.36 
 
 		 300 aa  199  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  40.13 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  40.2 
 
 		 314 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  39.19 
 
 		 288 aa  195  7e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  39.8 
 
 		 308 aa  195  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  38.81 
 
 		 299 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  40.2 
 
 		 312 aa  195  8.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  40.29 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  37.34 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  40.77 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  40.77 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  40.42 
 
 		 332 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  38.32 
 
 		 336 aa  192  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  39 
 
 		 326 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  39 
 
 		 326 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  36.88 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  40.77 
 
 		 434 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  36.88 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  39.19 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  37.46 
 
 		 304 aa  185  8e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  39.8 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  36.88 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  40.86 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  36.18 
 
 		 312 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4227  antirestriction protein  54.72 
 
 		 184 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0722776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  40.54 
 
 		 285 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  40 
 
 		 284 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  43.33 
 
 		 247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  41.13 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  34.28 
 
 		 323 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  35.74 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  34.91 
 
 		 384 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  35.19 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  33.55 
 
 		 322 aa  165  9e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  36.07 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  35.43 
 
 		 986 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  36.27 
 
 		 410 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  39.57 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  35.14 
 
 		 319 aa  156  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5409  hypothetical protein  43.07 
 
 		 260 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal  0.17576 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  32.29 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  33.01 
 
 		 1448 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  33.67 
 
 		 1580 aa  145  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1077 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  33.01 
 
 		 1448 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  32.3 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  34.09 
 
 		 1495 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2005  hypothetical protein  40.76 
 
 		 258 aa  143  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.146058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0034  putative DNA replication primase  32.89 
 
 		 682 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000123462  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0037  hypothetical protein  33.45 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  32.53 
 
 		 275 aa  129  7.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6843  domain of unknown function DUF1738  30.67 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal  0.17936 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  31.69 
 
 		 1457 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>