118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpl0037 on replicon NC_006366
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006366  plpl0037  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  590  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  36.7 
 
 
333 aa  157  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  36.49 
 
 
320 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  35.76 
 
 
312 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  35.54 
 
 
312 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  31.4 
 
 
384 aa  135  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  33.94 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  33.45 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  31.71 
 
 
299 aa  133  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  34.39 
 
 
332 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  34.11 
 
 
336 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  33.11 
 
 
335 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  34.39 
 
 
332 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  34.04 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  33.11 
 
 
344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  34.41 
 
 
328 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  30.58 
 
 
310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  35.41 
 
 
434 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  35.16 
 
 
285 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  32.29 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  33.84 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  32.83 
 
 
301 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  32.95 
 
 
308 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  34.51 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  33.33 
 
 
306 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  35.22 
 
 
314 aa  125  8.000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  30.41 
 
 
311 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  31.72 
 
 
308 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  35.42 
 
 
326 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  35.42 
 
 
326 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  32.55 
 
 
301 aa  123  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  34.29 
 
 
321 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  31.27 
 
 
315 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  32.99 
 
 
308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  32.41 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  32.53 
 
 
304 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  29.13 
 
 
1077 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  31.07 
 
 
294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  31.85 
 
 
323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  32.06 
 
 
284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  31.7 
 
 
322 aa  119  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  30.34 
 
 
299 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  31.25 
 
 
295 aa  119  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  30.04 
 
 
308 aa  118  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  31.85 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  31.39 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  28.89 
 
 
338 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  28.87 
 
 
326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  30.38 
 
 
313 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  30.97 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0034  putative DNA replication primase  30.24 
 
 
682 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000123462  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  32.16 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  30.32 
 
 
317 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  31.12 
 
 
319 aa  112  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  30.43 
 
 
321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  32.67 
 
 
1580 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  27.61 
 
 
327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  32.12 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  30.8 
 
 
317 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  29.24 
 
 
322 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  29.02 
 
 
318 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  32 
 
 
1448 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  32 
 
 
1448 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  28.72 
 
 
320 aa  108  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  29.84 
 
 
316 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  31.9 
 
 
312 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  28.52 
 
 
319 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  30.96 
 
 
362 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  31.65 
 
 
288 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  31.41 
 
 
986 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4151  domain of unknown function DUF1738  34.2 
 
 
296 aa  106  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  30.36 
 
 
410 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  30.9 
 
 
1495 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  29.62 
 
 
297 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  31.75 
 
 
313 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  30.91 
 
 
297 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  28.99 
 
 
316 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4983  hypothetical protein  33.78 
 
 
241 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4227  antirestriction protein  45.86 
 
 
184 aa  99.4  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0722776  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  27.96 
 
 
320 aa  99  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  27.96 
 
 
320 aa  99  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6843  domain of unknown function DUF1738  29.15 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal  0.17936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  27.31 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  30.84 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  27.3 
 
 
308 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  30.49 
 
 
316 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  29.89 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  31.33 
 
 
325 aa  93.6  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  28.63 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  29.89 
 
 
276 aa  92.8  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  29.07 
 
 
1457 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  26.94 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2408  domain of unknown function DUF1738  27.92 
 
 
313 aa  90.1  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038447  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  29.86 
 
 
660 aa  89.7  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  28.43 
 
 
1716 aa  89.4  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  29.53 
 
 
319 aa  89.4  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  28.75 
 
 
1449 aa  89  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  28.29 
 
 
304 aa  88.2  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  25 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  27.78 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>