114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0527 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  501  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  68.97 
 
 
299 aa  333  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  64.66 
 
 
304 aa  325  5e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  65.95 
 
 
301 aa  323  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  65.09 
 
 
299 aa  322  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  64.22 
 
 
301 aa  315  3e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  60 
 
 
308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  55.42 
 
 
308 aa  291  5e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4983  hypothetical protein  57.85 
 
 
241 aa  291  6e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  56.67 
 
 
308 aa  289  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  54.17 
 
 
308 aa  276  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  55.83 
 
 
308 aa  272  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  57.5 
 
 
306 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  54.58 
 
 
308 aa  267  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  56.25 
 
 
306 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  54.67 
 
 
310 aa  257  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  54.47 
 
 
362 aa  255  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  56.67 
 
 
306 aa  254  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  55.83 
 
 
306 aa  248  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  52.05 
 
 
311 aa  217  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  46.93 
 
 
313 aa  199  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  48.51 
 
 
285 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  50 
 
 
294 aa  190  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  46.55 
 
 
311 aa  189  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  43.28 
 
 
318 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  47.21 
 
 
295 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  44.67 
 
 
320 aa  185  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  45.8 
 
 
338 aa  184  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  44.54 
 
 
316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  45.73 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  43.98 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  46.03 
 
 
316 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  45.42 
 
 
247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  45.53 
 
 
312 aa  181  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  44.3 
 
 
317 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  44.54 
 
 
322 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  44.58 
 
 
317 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  41.56 
 
 
332 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  41.56 
 
 
332 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  41.56 
 
 
332 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  45.42 
 
 
248 aa  178  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  42.11 
 
 
312 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  39.22 
 
 
328 aa  176  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  41.56 
 
 
434 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  43.04 
 
 
326 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  42.45 
 
 
310 aa  174  8e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  39.22 
 
 
319 aa  174  9e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  42.92 
 
 
321 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  44.3 
 
 
318 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  43.83 
 
 
288 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  43.88 
 
 
316 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  42.08 
 
 
326 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  42.08 
 
 
326 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  44.54 
 
 
320 aa  168  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  44.54 
 
 
320 aa  168  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  39.91 
 
 
314 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  43.88 
 
 
308 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  42.8 
 
 
321 aa  162  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  39.92 
 
 
312 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  39.83 
 
 
300 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  41.67 
 
 
313 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  41.18 
 
 
319 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5409  hypothetical protein  45.15 
 
 
260 aa  155  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal  0.17576 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  40.08 
 
 
304 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2005  hypothetical protein  43.2 
 
 
258 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.146058  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  39.92 
 
 
312 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  39.27 
 
 
320 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  37.8 
 
 
297 aa  151  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  39.13 
 
 
297 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  38.75 
 
 
300 aa  148  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  35.14 
 
 
322 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  35.78 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  38.87 
 
 
1580 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  40 
 
 
410 aa  145  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  39.74 
 
 
300 aa  145  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  39.66 
 
 
284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  35.63 
 
 
336 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  38.49 
 
 
311 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  40.25 
 
 
320 aa  142  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  38 
 
 
1448 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  36.76 
 
 
335 aa  140  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  35.63 
 
 
344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  42.37 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  37.85 
 
 
1448 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  36 
 
 
986 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  37.1 
 
 
1077 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  34.96 
 
 
1495 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  38.03 
 
 
285 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  34.68 
 
 
1457 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4227  antirestriction protein  58.95 
 
 
184 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0722776  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  34.04 
 
 
384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1298  antirestriction protein-like  45.06 
 
 
199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430791  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  31.52 
 
 
323 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  33.87 
 
 
1449 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4265  antirestriction protein  40.36 
 
 
169 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.963524  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6843  domain of unknown function DUF1738  32.53 
 
 
296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal  0.17936 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5351  hypothetical protein  37.81 
 
 
220 aa  118  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.666575 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  34.52 
 
 
1716 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  48.8 
 
 
325 aa  116  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  37.34 
 
 
275 aa  115  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>