165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1266 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  100 
 
 		 660 aa  1347    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  47.39 
 
 		 280 aa  239  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  42.5 
 
 		 275 aa  211  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  41.55 
 
 		 297 aa  210  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2408  domain of unknown function DUF1738  40.79 
 
 		 313 aa  209  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038447  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  42.55 
 
 		 276 aa  191  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6843  domain of unknown function DUF1738  40.97 
 
 		 296 aa  190  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal  0.17936 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  37.67 
 
 		 319 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  34.97 
 
 		 322 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  32.26 
 
 		 312 aa  164  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  33.44 
 
 		 312 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  33 
 
 		 312 aa  159  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0073  DNA-methyltransferase-like  34.94 
 
 		 313 aa  157  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.648628 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  35.09 
 
 		 333 aa  156  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  33.44 
 
 		 1077 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  32.31 
 
 		 299 aa  152  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  35.74 
 
 		 317 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  33.22 
 
 		 320 aa  151  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  34.63 
 
 		 299 aa  151  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  31.54 
 
 		 310 aa  150  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1580 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  30.3 
 
 		 326 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  33 
 
 		 285 aa  149  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  32.57 
 
 		 1495 aa  148  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  34.85 
 
 		 321 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  32.9 
 
 		 320 aa  147  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  33.45 
 
 		 1448 aa  147  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  33.66 
 
 		 317 aa  146  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  33.1 
 
 		 328 aa  146  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  33.67 
 
 		 304 aa  145  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  34.22 
 
 		 321 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  33.45 
 
 		 410 aa  145  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  33.1 
 
 		 297 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  32.88 
 
 		 1448 aa  144  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  35 
 
 		 986 aa  144  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  32.62 
 
 		 314 aa  144  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  33.57 
 
 		 312 aa  143  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  33.21 
 
 		 301 aa  143  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  34.02 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  31.23 
 
 		 311 aa  143  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  32.87 
 
 		 315 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  33.45 
 
 		 362 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  141  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  141  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  34.81 
 
 		 295 aa  140  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  34.47 
 
 		 313 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  31.76 
 
 		 319 aa  139  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  31.85 
 
 		 318 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  32.86 
 
 		 332 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  32.86 
 
 		 332 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  32.86 
 
 		 332 aa  137  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  30.77 
 
 		 308 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  28.62 
 
 		 335 aa  136  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  32.86 
 
 		 434 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  33.22 
 
 		 294 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  32.89 
 
 		 323 aa  135  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  31.27 
 
 		 300 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  28.99 
 
 		 344 aa  134  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  33.92 
 
 		 288 aa  134  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  31.29 
 
 		 322 aa  134  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  32.87 
 
 		 318 aa  133  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  34.2 
 
 		 316 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  30.69 
 
 		 311 aa  133  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  30.36 
 
 		 319 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  30.53 
 
 		 285 aa  130  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  28.99 
 
 		 336 aa  130  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  30.5 
 
 		 299 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  32.84 
 
 		 316 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  31.73 
 
 		 301 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  31.33 
 
 		 1716 aa  128  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  30.92 
 
 		 306 aa  127  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  30.6 
 
 		 311 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  29.27 
 
 		 308 aa  125  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  29.33 
 
 		 320 aa  125  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  29.97 
 
 		 338 aa  124  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  32.2 
 
 		 313 aa  124  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  30.14 
 
 		 310 aa  124  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  31.06 
 
 		 306 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  29.9 
 
 		 297 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  32.96 
 
 		 326 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  32.96 
 
 		 326 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  31.12 
 
 		 306 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  30.42 
 
 		 306 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  29.71 
 
 		 304 aa  120  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  30.45 
 
 		 300 aa  120  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  39.16 
 
 		 557 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  29.68 
 
 		 308 aa  117  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  36.53 
 
 		 254 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  31.6 
 
 		 284 aa  115  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 658 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  29.53 
 
 		 308 aa  110  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  28.84 
 
 		 300 aa  110  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  34.2 
 
 		 242 aa  107  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  29.43 
 
 		 1457 aa  107  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  30.96 
 
 		 325 aa  107  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  30.07 
 
 		 308 aa  107  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  28.52 
 
 		 308 aa  106  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  29.1 
 
 		 1449 aa  107  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  33.2 
 
 		 248 aa  105  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4151  domain of unknown function DUF1738  32.64 
 
 		 296 aa  103  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>