133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0329 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  100 
 
 		 557 aa  1143    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3661  hypothetical protein  40.21 
 
 		 268 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2729  hypothetical protein  40.07 
 
 		 327 aa  184  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000436678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3689  hypothetical protein  40 
 
 		 268 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4966  hypothetical protein  37.94 
 
 		 267 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5396  hypothetical protein  37.94 
 
 		 267 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.613339  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  40.64 
 
 		 254 aa  171  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3129  hypothetical protein  35.69 
 
 		 282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.03549  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2891  hypothetical protein  36.56 
 
 		 277 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.458702  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0478  hypothetical protein  35.36 
 
 		 277 aa  166  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1380  hypothetical protein  36.56 
 
 		 277 aa  163  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.966548  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1768  hypothetical protein  35.74 
 
 		 277 aa  157  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000246433  hitchhiker  0.00548323 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  30.53 
 
 		 548 aa  156  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0746  hypothetical protein  33.82 
 
 		 288 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0060  hypothetical protein  32.5 
 
 		 282 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.218485  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03540  conserved hypothetical protein  33.81 
 
 		 281 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03483  hypothetical protein  33.81 
 
 		 281 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4673  hypothetical protein  32.14 
 
 		 289 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0070  hypothetical protein  32.27 
 
 		 282 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000494627  decreased coverage  0.00000000181014 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3215  hypothetical protein  31.32 
 
 		 288 aa  143  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2239  hypothetical protein  31.41 
 
 		 280 aa  143  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4362  hypothetical protein  35.44 
 
 		 520 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3355  hypothetical protein  31.41 
 
 		 280 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1409  hypothetical protein  31.41 
 
 		 280 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.180629 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3416  hypothetical protein  30.94 
 
 		 281 aa  141  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1283  hypothetical protein  37.68 
 
 		 269 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  43.21 
 
 		 658 aa  121  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  39.16 
 
 		 660 aa  120  9e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  40.48 
 
 		 450 aa  118  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  37.84 
 
 		 481 aa  117  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02811  conserved hypothetical protein  39.18 
 
 		 189 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000331292  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02762  hypothetical protein  39.18 
 
 		 189 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  40.24 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  37.65 
 
 		 569 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  33.33 
 
 		 451 aa  97.8  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  38.02 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  38.02 
 
 		 187 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0073  DNA-methyltransferase-like  33.33 
 
 		 313 aa  79.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.648628 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  37.4 
 
 		 187 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  31.75 
 
 		 1458 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  30.65 
 
 		 1447 aa  62  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  30.22 
 
 		 515 aa  61.6  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  31.16 
 
 		 1449 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  32.4 
 
 		 836 aa  59.3  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  32 
 
 		 1414 aa  59.7  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  28.79 
 
 		 1451 aa  58.9  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  30.22 
 
 		 1396 aa  57.8  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  28.72 
 
 		 1435 aa  57.4  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  29.95 
 
 		 1417 aa  57.4  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  31.28 
 
 		 836 aa  57  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  32.91 
 
 		 1700 aa  57  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1748 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  29.41 
 
 		 1459 aa  55.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5014  hypothetical protein  27.71 
 
 		 597 aa  55.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 1516 aa  55.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  26.06 
 
 		 1444 aa  55.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  29.24 
 
 		 1421 aa  55.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  28.1 
 
 		 1444 aa  54.7  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  28.72 
 
 		 1448 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  29.58 
 
 		 873 aa  54.3  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  26.2 
 
 		 1440 aa  53.5  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  25.13 
 
 		 470 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  28.64 
 
 		 1697 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  28.37 
 
 		 1437 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  25.54 
 
 		 1412 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4247  hypothetical protein  26.7 
 
 		 225 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4092  hypothetical protein  25.65 
 
 		 225 aa  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  26.05 
 
 		 860 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  25.11 
 
 		 824 aa  51.2  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  28.43 
 
 		 1649 aa  50.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  26.74 
 
 		 1440 aa  50.4  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  24.47 
 
 		 799 aa  50.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  23.23 
 
 		 527 aa  49.3  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  22.37 
 
 		 503 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  27.81 
 
 		 1440 aa  49.3  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  28.14 
 
 		 1703 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  32.48 
 
 		 545 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  27.86 
 
 		 1702 aa  49.3  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1886  hypothetical protein  24.64 
 
 		 266 aa  48.5  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5340  hypothetical protein  31.48 
 
 		 202 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  27.23 
 
 		 528 aa  48.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  31.18 
 
 		 1425 aa  48.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  33.05 
 
 		 200 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  23.25 
 
 		 827 aa  48.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  22.59 
 
 		 508 aa  47.8  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4825  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 260 aa  47.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  31.36 
 
 		 1669 aa  47.4  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  27.64 
 
 		 1697 aa  47.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  27.36 
 
 		 1701 aa  47.4  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0925  type I restriction-modification system, M subunit  30.66 
 
 		 535 aa  47  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000528021  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  28.03 
 
 		 389 aa  47  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  25.6 
 
 		 809 aa  47  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1440 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  27.12 
 
 		 554 aa  46.6  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  26.55 
 
 		 552 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  34.21 
 
 		 201 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  24.43 
 
 		 554 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  26.89 
 
 		 908 aa  46.6  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  23.04 
 
 		 554 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5719  hypothetical protein  33.71 
 
 		 205 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>