122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0395 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  716    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  91.92 
 
 		 336 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  94.33 
 
 		 335 aa  652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  57.14 
 
 		 323 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  47.52 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  40.95 
 
 		 322 aa  279  5e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  46.86 
 
 		 312 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  44.16 
 
 		 320 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  43.93 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  44.16 
 
 		 321 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  42.72 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  42.39 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  43.09 
 
 		 317 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  42.44 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  42.64 
 
 		 315 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  43.85 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  42.23 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  40.6 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  41.07 
 
 		 319 aa  222  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  40.95 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  39.38 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  40.45 
 
 		 316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  41.18 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  38.53 
 
 		 320 aa  219  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  40.62 
 
 		 311 aa  219  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  38.53 
 
 		 320 aa  219  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  41.31 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  41.97 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  42.48 
 
 		 332 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  42.16 
 
 		 332 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  42.16 
 
 		 332 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  38.82 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  41.51 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  39.81 
 
 		 313 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  40.13 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  40.13 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  38.34 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  40.13 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  39.81 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  39.07 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  36.91 
 
 		 362 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  38.36 
 
 		 285 aa  189  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  35.99 
 
 		 384 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  37.58 
 
 		 299 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  35.69 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  39.51 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  36.88 
 
 		 308 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  38.56 
 
 		 299 aa  182  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  37.46 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  36.42 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  36.93 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  36.51 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  37.96 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  37.42 
 
 		 308 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  37.67 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  35.71 
 
 		 986 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1077 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  38.94 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  34.42 
 
 		 410 aa  173  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1448 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  37.78 
 
 		 306 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1580 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  35.71 
 
 		 1448 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  37.58 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  38.22 
 
 		 248 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  34.66 
 
 		 310 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  38.41 
 
 		 306 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  38.38 
 
 		 247 aa  169  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  34.31 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  38.1 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1495 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  38.41 
 
 		 308 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4151  domain of unknown function DUF1738  33.13 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  33.23 
 
 		 319 aa  166  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  34.22 
 
 		 297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  40.14 
 
 		 285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  32.27 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  35.05 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  34.26 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  37.91 
 
 		 284 aa  155  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0034  putative DNA replication primase  33.24 
 
 		 682 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000123462  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  36.25 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  36.59 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  33.78 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  31.46 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  32.92 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6843  domain of unknown function DUF1738  32.31 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal  0.17936 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  34.58 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  32.46 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  35.63 
 
 		 242 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  34.01 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2005  hypothetical protein  37 
 
 		 258 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.146058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  31.61 
 
 		 297 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  32.31 
 
 		 1457 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  32.25 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  28.99 
 
 		 660 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  32.1 
 
 		 1449 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  32.13 
 
 		 1716 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  32.19 
 
 		 310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0037  hypothetical protein  33.11 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>