123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1780 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  100 
 
 		 322 aa  674    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  41.21 
 
 		 335 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  40.95 
 
 		 344 aa  279  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  40.26 
 
 		 336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  42.09 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  44.22 
 
 		 320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  41.47 
 
 		 312 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  43.14 
 
 		 312 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  40.97 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  38.46 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  38.96 
 
 		 326 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  41.78 
 
 		 321 aa  215  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  38.46 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  38.26 
 
 		 321 aa  212  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  38.71 
 
 		 318 aa  208  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  39.26 
 
 		 299 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  37.75 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  37.67 
 
 		 311 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  39.67 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  37.54 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  39.46 
 
 		 333 aa  203  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  37.91 
 
 		 316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  36.69 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  36.13 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  36.34 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  38.31 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  35.39 
 
 		 294 aa  195  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  38.98 
 
 		 301 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  38.54 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  37.85 
 
 		 304 aa  192  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  37.58 
 
 		 332 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  37.58 
 
 		 332 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  37.58 
 
 		 332 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  38.82 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  39.73 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  36.1 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  35.6 
 
 		 320 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  35.6 
 
 		 320 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  37.58 
 
 		 434 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  36.56 
 
 		 299 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  37.87 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  34.94 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  36.99 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  37.46 
 
 		 326 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  37.46 
 
 		 326 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  35.28 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  36.81 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  34.56 
 
 		 288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  36.78 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  35.27 
 
 		 299 aa  178  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  34.95 
 
 		 297 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  34.97 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  34.82 
 
 		 1077 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  34.29 
 
 		 1495 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  33.76 
 
 		 1448 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  33.76 
 
 		 1448 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  35.42 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  36.4 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  34.97 
 
 		 660 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  35.22 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  37.25 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  35.18 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  34.27 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  33.11 
 
 		 1580 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  33.33 
 
 		 384 aa  166  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  33.55 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  33.23 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  36.42 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  34.6 
 
 		 306 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  34.53 
 
 		 319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  33.33 
 
 		 986 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  33.87 
 
 		 306 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  33.97 
 
 		 308 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  32.46 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  33.55 
 
 		 410 aa  158  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  34.19 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  33.44 
 
 		 306 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  33.64 
 
 		 308 aa  155  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  36.55 
 
 		 247 aa  155  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  31.25 
 
 		 320 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  35.25 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  35.64 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  35.04 
 
 		 248 aa  149  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  34.53 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  31.92 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  32.45 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  35.14 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  31.07 
 
 		 308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  33.01 
 
 		 308 aa  145  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  30.13 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  31.68 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6843  domain of unknown function DUF1738  33.86 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal  0.17936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  32.96 
 
 		 325 aa  142  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  32.12 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  29.82 
 
 		 1716 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  31.49 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2408  domain of unknown function DUF1738  30.97 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038447  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  31.83 
 
 		 1449 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  32.43 
 
 		 1457 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4151  domain of unknown function DUF1738  31.91 
 
 		 296 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>