119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5920 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  100 
 
 		 311 aa  623  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  41.51 
 
 		 344 aa  203  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  41.72 
 
 		 335 aa  202  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  41.9 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  39.23 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  41.01 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  40.38 
 
 		 304 aa  196  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  39.67 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  40.88 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  38.29 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  38.33 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  40 
 
 		 301 aa  188  9e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  38.1 
 
 		 311 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  37.79 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  39.66 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  37.46 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  37.46 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  37.46 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  36.21 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  37.87 
 
 		 384 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  39.14 
 
 		 320 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  41.2 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  40.4 
 
 		 285 aa  176  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  36.68 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  36.68 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  38.46 
 
 		 295 aa  176  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  40.82 
 
 		 311 aa  175  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  35.18 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  39.74 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  37 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  37.5 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  36.45 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  38.59 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  39.53 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  41.28 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  39.6 
 
 		 317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  39.25 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  39.27 
 
 		 326 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  35.22 
 
 		 362 aa  172  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  40.36 
 
 		 284 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  35.17 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  38.49 
 
 		 318 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  36.59 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  35.18 
 
 		 322 aa  167  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  38.19 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  38.24 
 
 		 410 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  36.51 
 
 		 1077 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  39.34 
 
 		 308 aa  165  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  38.49 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  38.49 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  39.57 
 
 		 316 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  36.51 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  38.36 
 
 		 322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  36.07 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  38.54 
 
 		 313 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  36.63 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  37.83 
 
 		 306 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  37.91 
 
 		 288 aa  159  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  37.62 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  37.75 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  36.68 
 
 		 312 aa  159  8e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2408  domain of unknown function DUF1738  35.2 
 
 		 313 aa  159  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038447  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  36.16 
 
 		 1448 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  38.36 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  36.16 
 
 		 1448 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  38.72 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  34.11 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  36.72 
 
 		 1580 aa  155  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  32.79 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  35.83 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  35.78 
 
 		 1495 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  34.75 
 
 		 308 aa  153  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  37.15 
 
 		 300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  36.84 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  36.51 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  34.11 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  34.65 
 
 		 986 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  36.4 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  34.31 
 
 		 275 aa  148  9e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  40.33 
 
 		 247 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  35.44 
 
 		 300 aa  145  9e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  33.76 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  33.55 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  35.62 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  38.49 
 
 		 242 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  29.14 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  32.12 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  39.09 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  30.69 
 
 		 660 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4151  domain of unknown function DUF1738  30.33 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  34.81 
 
 		 320 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  31.8 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4227  antirestriction protein  48.23 
 
 		 184 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0722776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  31.13 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  31.01 
 
 		 280 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0037  hypothetical protein  30.41 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  29.32 
 
 		 276 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4983  hypothetical protein  34.92 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  30.77 
 
 		 1457 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0034  putative DNA replication primase  32.69 
 
 		 682 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000123462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>