16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0039 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0039  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  756    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4528  hypothetical protein  92.31 
 
 		 442 aa  714    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103833  normal  0.57888 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6349  hypothetical protein  39.33 
 
 		 310 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  37.59 
 
 		 1457 aa  179  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  36.9 
 
 		 1449 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  38.64 
 
 		 1716 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  38.52 
 
 		 569 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3226  domain of unknown function DUF1738  30.29 
 
 		 178 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.60789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0059  hypothetical protein  33.56 
 
 		 453 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322445 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0031  hypothetical protein  33.56 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0005  hypothetical protein  35.25 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0062  hypothetical protein  32.89 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08165  DNA repair protein RadC  60.47 
 
 		 305 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9875  hypothetical protein  26.49 
 
 		 284 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 658 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2241  hypothetical protein  66.67 
 
 		 304 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>