36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0222 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  925    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4362  hypothetical protein  39.09 
 
 		 520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  38.29 
 
 		 254 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  33.33 
 
 		 557 aa  98.2  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  32.54 
 
 		 660 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 658 aa  88.6  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  35.03 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  38.36 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0073  DNA-methyltransferase-like  31.82 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.648628 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  29.1 
 
 		 548 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  32.09 
 
 		 481 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  33.33 
 
 		 569 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  31.45 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  29.55 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  29.84 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  31.5 
 
 		 824 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1425 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5014  hypothetical protein  31.69 
 
 		 597 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  32.03 
 
 		 515 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  33.8 
 
 		 1458 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  33.87 
 
 		 1414 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  29.33 
 
 		 1413 aa  47  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  28.36 
 
 		 1463 aa  46.6  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  31.65 
 
 		 587 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  32.68 
 
 		 1451 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  34.19 
 
 		 1448 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2374  methyltransferase  34.62 
 
 		 189 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.1111  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2754  methyltransferase, putative  34.62 
 
 		 189 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  29.87 
 
 		 1396 aa  45.8  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  32.17 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  29.71 
 
 		 1440 aa  43.9  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  28.64 
 
 		 1447 aa  43.9  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  29.13 
 
 		 524 aa  43.5  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  36.23 
 
 		 836 aa  43.9  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  32.93 
 
 		 1421 aa  43.5  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  24.24 
 
 		 891 aa  43.5  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>