60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5206 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  45.57 
 
 		 1437 aa  1117    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  47.8 
 
 		 1449 aa  1170    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  48.32 
 
 		 1440 aa  1201    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  45.96 
 
 		 1440 aa  1139    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  47.66 
 
 		 1448 aa  1174    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  100 
 
 		 1414 aa  2813    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  72.34 
 
 		 1421 aa  2018    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  44.47 
 
 		 1425 aa  1030    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  48.27 
 
 		 1435 aa  1194    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  47.75 
 
 		 1446 aa  1172    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  47.54 
 
 		 1444 aa  1178    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  47.05 
 
 		 1474 aa  1147    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  44.4 
 
 		 1412 aa  1005    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  47.57 
 
 		 1451 aa  1186    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  47.03 
 
 		 1439 aa  1147    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  47.03 
 
 		 1439 aa  1147    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  48.35 
 
 		 1440 aa  1177    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  47.93 
 
 		 1447 aa  1178    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  46.76 
 
 		 1444 aa  1152    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  45.22 
 
 		 1458 aa  1036    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  42.61 
 
 		 1536 aa  1110    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  46.01 
 
 		 1459 aa  1120    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  44.66 
 
 		 1413 aa  1006    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  42.38 
 
 		 1529 aa  1095    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  46.63 
 
 		 1455 aa  1154    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  45.79 
 
 		 1459 aa  1131    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  43.8 
 
 		 1440 aa  1078    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  46.97 
 
 		 1396 aa  1148    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  44.73 
 
 		 1498 aa  1113    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4223  putative methylase/helicase  47.59 
 
 		 896 aa  770    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.233912  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  45.67 
 
 		 1463 aa  1125    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  44.67 
 
 		 836 aa  572  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  44.24 
 
 		 824 aa  568  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  44.98 
 
 		 836 aa  558  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0437  putative methylase/helicase  43.93 
 
 		 611 aa  439  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40550  predicted protein  34.18 
 
 		 950 aa  390  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3694  hypothetical protein  41.34 
 
 		 623 aa  372  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4003  hypothetical protein  40.29 
 
 		 623 aa  368  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  40.41 
 
 		 684 aa  320  7.999999999999999e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  39.16 
 
 		 515 aa  204  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30868  predicted protein  32.22 
 
 		 1487 aa  196  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186936  normal  0.423198 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  52.17 
 
 		 397 aa  98.6  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  24.23 
 
 		 2123 aa  82.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  33.97 
 
 		 254 aa  75.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  35.87 
 
 		 569 aa  66.6  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  32 
 
 		 557 aa  59.3  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  29.48 
 
 		 660 aa  57  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 658 aa  55.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  38.46 
 
 		 548 aa  55.5  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  28.29 
 
 		 1328 aa  55.1  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  36.36 
 
 		 481 aa  52  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0073  DNA-methyltransferase-like  29.92 
 
 		 313 aa  50.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.648628 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4362  hypothetical protein  29.83 
 
 		 520 aa  49.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  27.65 
 
 		 285 aa  48.9  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  22.63 
 
 		 490 aa  48.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  29.21 
 
 		 449 aa  48.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  33.87 
 
 		 451 aa  47.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 450 aa  47.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  23.39 
 
 		 527 aa  47  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5275  N-6 DNA methylase  28.12 
 
 		 623 aa  45.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>