51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1475 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  79.19 
 
 
1444 aa  2284    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  62.75 
 
 
1463 aa  1802    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  75.96 
 
 
1440 aa  2170    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  75.69 
 
 
1448 aa  2111    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  48.22 
 
 
1414 aa  1177    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  44.08 
 
 
1425 aa  1050    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  46.58 
 
 
1421 aa  1124    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  100 
 
 
1435 aa  2883    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  74.05 
 
 
1437 aa  2060    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  73.27 
 
 
1440 aa  2073    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  73.88 
 
 
1474 aa  2097    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  43.91 
 
 
1412 aa  992    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  74.02 
 
 
1451 aa  2136    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  74.1 
 
 
1439 aa  2114    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  74.1 
 
 
1439 aa  2114    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  75.27 
 
 
1440 aa  2139    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  75.87 
 
 
1447 aa  2140    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  74.65 
 
 
1446 aa  2122    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  72.87 
 
 
1449 aa  2080    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  75.42 
 
 
1444 aa  2156    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  51.24 
 
 
1440 aa  1384    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  52.89 
 
 
1536 aa  1500    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4223  putative methylase/helicase  66.82 
 
 
896 aa  1164    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.233912  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  63.57 
 
 
1498 aa  1816    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  67.41 
 
 
1396 aa  1855    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  67.68 
 
 
1459 aa  1899    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  53.06 
 
 
1529 aa  1498    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  45.15 
 
 
1413 aa  1080    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  75.35 
 
 
1459 aa  2147    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  73.79 
 
 
1455 aa  2133    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  58.14 
 
 
1458 aa  1544    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  47.08 
 
 
836 aa  613  9.999999999999999e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  47.65 
 
 
836 aa  616  9.999999999999999e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  42.86 
 
 
824 aa  588  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  53.04 
 
 
684 aa  576  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0437  putative methylase/helicase  47.46 
 
 
611 aa  498  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  60.1 
 
 
515 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3694  hypothetical protein  44.33 
 
 
623 aa  423  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228295  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4003  hypothetical protein  43.63 
 
 
623 aa  423  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40550  predicted protein  35.32 
 
 
950 aa  412  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30868  predicted protein  34 
 
 
1487 aa  207  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186936  normal  0.423198 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  65.59 
 
 
397 aa  142  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0597  helicase  67.8 
 
 
137 aa  89  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.952522  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0003  helicase. putatve  22.43 
 
 
2133 aa  85.5  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  25.86 
 
 
2123 aa  82.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  36.13 
 
 
254 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  28.72 
 
 
557 aa  57.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4362  hypothetical protein  31.6 
 
 
520 aa  52.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  29.47 
 
 
658 aa  47.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  28.96 
 
 
569 aa  47.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3433  hypothetical protein  67.74 
 
 
105 aa  46.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.486333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>