96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3449 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  100 
 
 		 389 aa  809    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  52.31 
 
 		 423 aa  401  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  30.41 
 
 		 527 aa  93.6  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  28.73 
 
 		 466 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  31.41 
 
 		 552 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  25.68 
 
 		 523 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  30.26 
 
 		 554 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  34.55 
 
 		 1036 aa  67.8  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  30.17 
 
 		 587 aa  66.2  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  28.49 
 
 		 524 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  27.65 
 
 		 521 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  27.86 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  23.37 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  24.62 
 
 		 573 aa  63.2  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  25.67 
 
 		 995 aa  62.4  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  36.04 
 
 		 950 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  32.56 
 
 		 1177 aa  61.6  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  28.35 
 
 		 527 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2534  hypothetical protein  24.74 
 
 		 563 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  27.03 
 
 		 604 aa  60.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  24 
 
 		 533 aa  60.8  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  24.88 
 
 		 522 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  31.45 
 
 		 1209 aa  58.9  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1338 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4045  hypothetical protein  27.16 
 
 		 495 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539039  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  30.53 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  24.62 
 
 		 595 aa  57.4  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  27.54 
 
 		 553 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  24.88 
 
 		 1252 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  27.05 
 
 		 836 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  25.42 
 
 		 1170 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  36.09 
 
 		 449 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1299 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  28 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  28.93 
 
 		 1058 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  29.94 
 
 		 478 aa  53.5  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  27.85 
 
 		 1693 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2496  hypothetical protein  25.51 
 
 		 488 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  26.19 
 
 		 974 aa  52.4  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  28.7 
 
 		 629 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  26.36 
 
 		 1257 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  25 
 
 		 557 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 450 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1612 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  36.17 
 
 		 285 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  26.98 
 
 		 562 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  25.86 
 
 		 1256 aa  50.8  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  30.36 
 
 		 1154 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0459  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  25.43 
 
 		 579 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  21.86 
 
 		 539 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  25.37 
 
 		 1432 aa  50.4  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  26.96 
 
 		 1244 aa  50.4  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  26.4 
 
 		 1132 aa  50.4  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  28.83 
 
 		 1194 aa  50.1  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  28.18 
 
 		 1426 aa  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1147 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  29.53 
 
 		 569 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0686  putative RNA methylase  30.95 
 
 		 224 aa  48.9  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  22.73 
 
 		 578 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  22.73 
 
 		 578 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  28.07 
 
 		 504 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  31.25 
 
 		 225 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  23.08 
 
 		 1076 aa  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1016  N-6 DNA methylase  24.71 
 
 		 485 aa  47.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  28.03 
 
 		 557 aa  47  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  26.14 
 
 		 254 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  25.93 
 
 		 1159 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  29.46 
 
 		 1020 aa  46.2  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  23.44 
 
 		 570 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  29.12 
 
 		 1722 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1409  N-6 DNA methylase  21.98 
 
 		 698 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  31.97 
 
 		 1669 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  23.86 
 
 		 492 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  22.28 
 
 		 534 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2227  hypothetical protein  28.26 
 
 		 495 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  32.88 
 
 		 1120 aa  45.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  32.14 
 
 		 1697 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1125 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  32.17 
 
 		 451 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2532  hypothetical protein  22.28 
 
 		 497 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.928699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  36.36 
 
 		 518 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0961  N-6 DNA methylase  24.71 
 
 		 677 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  26.04 
 
 		 481 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.52 
 
 		 276 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  31.43 
 
 		 1703 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0730  N-6 DNA methylase  25.29 
 
 		 329 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  23.71 
 
 		 1186 aa  44.3  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  22.81 
 
 		 1241 aa  43.9  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  27.53 
 
 		 658 aa  43.9  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4773  hypothetical protein  24.63 
 
 		 328 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59530  hypothetical protein  25 
 
 		 483 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188675  hitchhiker  6.864800000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  27.71 
 
 		 317 aa  42.7  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4774  hypothetical protein  24.14 
 
 		 330 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  19.78 
 
 		 1270 aa  42.7  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  24.09 
 
 		 314 aa  42.7  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>