126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3732 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  36.38 
 
 		 1669 aa  844    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  35.17 
 
 		 1669 aa  855    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  33.2 
 
 		 1726 aa  775    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  33.05 
 
 		 1706 aa  763    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  54.23 
 
 		 1703 aa  1788    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  56.85 
 
 		 1700 aa  1801    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  57.59 
 
 		 1516 aa  1687    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  32.78 
 
 		 1575 aa  736    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  32.65 
 
 		 1649 aa  735    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  35.72 
 
 		 1642 aa  869    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  32.69 
 
 		 2098 aa  736    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  30.82 
 
 		 1932 aa  706    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  57.06 
 
 		 1748 aa  1807    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  55.01 
 
 		 1702 aa  1772    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  57.58 
 
 		 1417 aa  1538    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  56.21 
 
 		 1697 aa  1752    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1693 aa  3466    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  32.96 
 
 		 1606 aa  745    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  33.27 
 
 		 2077 aa  861    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  54.66 
 
 		 1211 aa  1224    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  53.86 
 
 		 1697 aa  1757    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  54.71 
 
 		 1701 aa  1761    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  30.25 
 
 		 1934 aa  696    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  28.79 
 
 		 2274 aa  630  1e-179  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  31.94 
 
 		 1956 aa  613  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  34.73 
 
 		 1925 aa  603  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  28.79 
 
 		 2570 aa  598  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 1594 aa  596  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 1674 aa  565  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  27.38 
 
 		 2117 aa  547  1e-154  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  32.31 
 
 		 1722 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  34.65 
 
 		 976 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  32.6 
 
 		 2005 aa  382  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  46.28 
 
 		 470 aa  345  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  28.41 
 
 		 761 aa  233  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  47.25 
 
 		 284 aa  231  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  29.64 
 
 		 763 aa  219  4e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  26.36 
 
 		 766 aa  184  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 577 aa  181  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  33.2 
 
 		 526 aa  137  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4314  adenine-specific DNA methylase-like protein  38.76 
 
 		 246 aa  108  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.1972  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  29.74 
 
 		 339 aa  87  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  29.01 
 
 		 678 aa  85.9  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  31.2 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  31.06 
 
 		 341 aa  84.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  26.36 
 
 		 1328 aa  79.7  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7033  hypothetical protein  43.96 
 
 		 97 aa  68.9  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  37.11 
 
 		 894 aa  67.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  24.86 
 
 		 958 aa  67  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  29.81 
 
 		 527 aa  65.9  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  24.57 
 
 		 958 aa  65.5  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  31.21 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  31.47 
 
 		 900 aa  61.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  28.22 
 
 		 1379 aa  61.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  29.63 
 
 		 969 aa  60.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  39.24 
 
 		 950 aa  59.3  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0072  RecQ helicase, putative  31.39 
 
 		 468 aa  59.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  28.7 
 
 		 933 aa  58.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  28.75 
 
 		 1116 aa  58.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  28.3 
 
 		 986 aa  58.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  30 
 
 		 254 aa  55.8  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  27.65 
 
 		 405 aa  55.5  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  34.94 
 
 		 953 aa  55.5  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  29 
 
 		 517 aa  53.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  35.71 
 
 		 940 aa  54.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  23.46 
 
 		 477 aa  54.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  31.46 
 
 		 968 aa  53.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  26.74 
 
 		 1082 aa  53.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  22.37 
 
 		 572 aa  53.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  35.06 
 
 		 948 aa  53.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  29.01 
 
 		 285 aa  52.8  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  36.25 
 
 		 1177 aa  52.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  27.85 
 
 		 389 aa  52.8  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0219  helicase-like  25.87 
 
 		 840 aa  52  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000357618  hitchhiker  0.00781123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  33.73 
 
 		 957 aa  52  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  28.44 
 
 		 946 aa  50.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  31.18 
 
 		 945 aa  51.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  31.82 
 
 		 941 aa  50.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  25.69 
 
 		 1058 aa  51.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  37.1 
 
 		 1049 aa  51.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  31.43 
 
 		 889 aa  50.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  36.71 
 
 		 949 aa  50.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  29.93 
 
 		 1201 aa  50.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  35.53 
 
 		 919 aa  50.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  29.93 
 
 		 1201 aa  50.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  35.23 
 
 		 1147 aa  50.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  28.92 
 
 		 1095 aa  50.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.23 
 
 		 949 aa  49.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  33.7 
 
 		 1046 aa  49.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  27.64 
 
 		 528 aa  49.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  27.5 
 
 		 466 aa  49.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  24.44 
 
 		 490 aa  49.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  30.51 
 
 		 910 aa  48.9  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  29.32 
 
 		 922 aa  48.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  27.08 
 
 		 511 aa  48.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  28.57 
 
 		 1065 aa  48.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  28.57 
 
 		 1065 aa  48.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  27.03 
 
 		 1043 aa  48.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  27.86 
 
 		 595 aa  48.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  32 
 
 		 669 aa  48.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>