53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4293 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  100 
 
 		 539 aa  1110    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  74.48 
 
 		 534 aa  815    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  47.5 
 
 		 522 aa  495  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  25.35 
 
 		 533 aa  141  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  25.05 
 
 		 523 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  23.86 
 
 		 521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0459  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  26.99 
 
 		 579 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  26.31 
 
 		 527 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  27.82 
 
 		 552 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  24.9 
 
 		 489 aa  91.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2268  hypothetical protein  47.92 
 
 		 142 aa  90.9  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  27.13 
 
 		 554 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  24.85 
 
 		 553 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  20.08 
 
 		 524 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4045  hypothetical protein  23.66 
 
 		 495 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539039  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2209  DNA methylase (modification methylase) (methyltransferase)  24.74 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000172069  normal  0.0419277 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2786  hypothetical protein  25.98 
 
 		 504 aa  70.1  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 694 aa  67.8  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  26.64 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  20.36 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  23.44 
 
 		 1194 aa  59.3  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2227  hypothetical protein  25.48 
 
 		 495 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1210 aa  58.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  28.71 
 
 		 1154 aa  57  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  25.45 
 
 		 629 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1177 aa  55.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  25.37 
 
 		 1244 aa  55.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  22.93 
 
 		 1257 aa  55.5  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1184 aa  54.7  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4247  hypothetical protein  27 
 
 		 509 aa  54.3  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102223  hitchhiker  0.00000000249407 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2532  hypothetical protein  25.96 
 
 		 497 aa  53.5  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.928699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  24.61 
 
 		 974 aa  52.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  22.81 
 
 		 1209 aa  51.2  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  21.86 
 
 		 389 aa  50.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  27.31 
 
 		 604 aa  50.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  24.06 
 
 		 423 aa  50.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  21.46 
 
 		 570 aa  49.7  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  25.98 
 
 		 478 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  22.46 
 
 		 493 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  21.01 
 
 		 527 aa  48.9  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  32.53 
 
 		 1036 aa  48.5  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  25.66 
 
 		 587 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2496  hypothetical protein  19.5 
 
 		 488 aa  47.4  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  20.45 
 
 		 1612 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0309  hypothetical protein  21.95 
 
 		 691 aa  47  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  24.88 
 
 		 950 aa  47  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3090  site-specific DNA-methyltransferase  23.94 
 
 		 527 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  25.98 
 
 		 995 aa  45.8  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  19.17 
 
 		 1076 aa  45.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  22.61 
 
 		 1159 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  19.7 
 
 		 410 aa  44.3  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  22.19 
 
 		 416 aa  43.9  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2534  hypothetical protein  24.89 
 
 		 563 aa  43.5  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>