34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2532 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007616  NmulC_2786  hypothetical protein  63.67 
 
 
504 aa  647    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2532  hypothetical protein  100 
 
 
497 aa  1025    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.928699  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2496  hypothetical protein  59.06 
 
 
488 aa  592  1e-168  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3090  site-specific DNA-methyltransferase  57.69 
 
 
527 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4247  hypothetical protein  43.84 
 
 
509 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102223  hitchhiker  0.00000000249407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2227  hypothetical protein  43.32 
 
 
495 aa  375  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0104  Eco57I restriction endonuclease  38.2 
 
 
499 aa  266  5e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  25.05 
 
 
573 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  23.99 
 
 
595 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  28.04 
 
 
604 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  24.24 
 
 
523 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  21.49 
 
 
405 aa  82.8  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  26.61 
 
 
578 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  26.61 
 
 
578 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2534  hypothetical protein  22.57 
 
 
563 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  23.64 
 
 
584 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  22.82 
 
 
533 aa  65.5  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  26.27 
 
 
539 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  30.11 
 
 
466 aa  57  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  28.31 
 
 
534 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf681  methyltransferase, HsdM related  23.32 
 
 
517 aa  52.8  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000145801  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  24.89 
 
 
521 aa  50.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  25.65 
 
 
522 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  22.66 
 
 
389 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  28.68 
 
 
489 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  23.27 
 
 
527 aa  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  26.07 
 
 
527 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0062  hypothetical protein  23.87 
 
 
422 aa  47.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  27.69 
 
 
1722 aa  47  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  23.39 
 
 
557 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0330  DNA methylase family protein  18.18 
 
 
402 aa  44.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00332873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  25.22 
 
 
629 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  28.46 
 
 
1194 aa  43.9  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  25.46 
 
 
730 aa  43.5  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>