87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5445 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  100 
 
 		 552 aa  1104    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  81.47 
 
 		 554 aa  875    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  34.94 
 
 		 553 aa  250  6e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  32.99 
 
 		 489 aa  211  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  35.67 
 
 		 527 aa  208  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2209  DNA methylase (modification methylase) (methyltransferase)  29.59 
 
 		 415 aa  181  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000172069  normal  0.0419277 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  23.67 
 
 		 524 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  22.27 
 
 		 523 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  21.87 
 
 		 533 aa  143  8e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  22.85 
 
 		 521 aa  123  9e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4045  hypothetical protein  27.54 
 
 		 495 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539039  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0459  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  26.79 
 
 		 579 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  28.07 
 
 		 539 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  26.69 
 
 		 534 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  25.14 
 
 		 694 aa  95.9  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  28.5 
 
 		 587 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  27.78 
 
 		 527 aa  92.4  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  29.17 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  25 
 
 		 522 aa  89.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  33.16 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  24.92 
 
 		 673 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  30.94 
 
 		 629 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  26 
 
 		 707 aa  63.5  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  30.26 
 
 		 285 aa  62.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1210 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  26.86 
 
 		 573 aa  57.8  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  22.43 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0309  hypothetical protein  25.76 
 
 		 691 aa  57.4  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  27.41 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  28.5 
 
 		 503 aa  57  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  24.22 
 
 		 595 aa  56.2  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2227  hypothetical protein  26.96 
 
 		 495 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  32.68 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  24.39 
 
 		 481 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 450 aa  52.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3923  putative Vgr-related protein  32.35 
 
 		 626 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  23.27 
 
 		 480 aa  51.6  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  28.38 
 
 		 275 aa  51.2  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  23.28 
 
 		 570 aa  51.2  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0162  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1016 aa  50.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  30.5 
 
 		 1036 aa  50.8  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  22.82 
 
 		 730 aa  50.4  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0961  N-6 DNA methylase  26.74 
 
 		 677 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  23.56 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3672  type I restriction-modification system, M subunit  26.37 
 
 		 910 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  26.79 
 
 		 562 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4082  type I restriction-modification system, M subunit  26.92 
 
 		 863 aa  48.5  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 526 aa  48.9  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3536  type I restriction-modification system, M subunit  26.92 
 
 		 863 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  28.65 
 
 		 511 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  21.25 
 
 		 974 aa  48.1  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  25.21 
 
 		 486 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  25.69 
 
 		 652 aa  47.8  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  28.99 
 
 		 528 aa  47.4  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1096  N-6 DNA methylase  24.63 
 
 		 486 aa  47.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  23.55 
 
 		 496 aa  47.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  27.65 
 
 		 518 aa  47  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0636  N-6 DNA methylase  27.2 
 
 		 545 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  20.17 
 
 		 995 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  23.32 
 
 		 528 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.27 
 
 		 1194 aa  46.6  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  26.55 
 
 		 557 aa  46.6  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  28.9 
 
 		 517 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2085  N-6 DNA methylase  22.34 
 
 		 711 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000172006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0261  hypothetical protein  27.44 
 
 		 680 aa  45.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.746292  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.97 
 
 		 538 aa  45.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2559  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.45 
 
 		 333 aa  45.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  26.89 
 
 		 557 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4458  type I restriction-modification system, M subunit  28.02 
 
 		 863 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  24.19 
 
 		 799 aa  45.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  22.28 
 
 		 810 aa  44.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  21.6 
 
 		 478 aa  45.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  32.11 
 
 		 792 aa  44.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  21.9 
 
 		 1159 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1850  type I restriction-modification system, M subunit  23.4 
 
 		 489 aa  44.3  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  24.43 
 
 		 504 aa  44.7  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  27.81 
 
 		 519 aa  44.3  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  24.62 
 
 		 490 aa  43.5  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  40 
 
 		 1243 aa  43.9  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5791  putative methylase  36.36 
 
 		 235 aa  43.9  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  21.97 
 
 		 522 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1241 aa  43.5  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  27.33 
 
 		 276 aa  43.5  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  28.19 
 
 		 532 aa  43.5  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  28.32 
 
 		 518 aa  43.5  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1959  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.27 
 
 		 855 aa  43.5  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1915  type I restriction-modification system, M subunit  24.31 
 
 		 853 aa  43.5  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.93858  hitchhiker  0.00587021 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>