246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0748 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 504 aa  1025    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  27.24 
 
 		 694 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  29.88 
 
 		 974 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  24.69 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  29.2 
 
 		 562 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1210 aa  75.1  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0857  N-6 DNA methylase  24.8 
 
 		 495 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.015495  normal  0.121553 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3517  N-6 DNA methylase  22.92 
 
 		 486 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1201  N-6 DNA methylase  22.31 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721125  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  27.8 
 
 		 523 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  28.37 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  26.13 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1184 aa  67.8  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0084  N-6 DNA methylase  22.37 
 
 		 495 aa  67.8  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  24.89 
 
 		 557 aa  67  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0392  N-6 DNA methylase  23.8 
 
 		 967 aa  66.6  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  24.18 
 
 		 995 aa  65.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  22.86 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  24.76 
 
 		 950 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  22.71 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  23.77 
 
 		 871 aa  63.9  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  25.82 
 
 		 1343 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3269  type I restriction-modification system specificity subunit  20.51 
 
 		 498 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.266741  normal  0.0966647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  23.71 
 
 		 587 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  27.35 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1393  restriction and modification enzyme CjeI  23.1 
 
 		 1285 aa  60.8  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  21.34 
 
 		 928 aa  60.8  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1036 aa  60.8  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  22.53 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4352  N-6 DNA methylase  27.16 
 
 		 565 aa  60.1  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  23.32 
 
 		 493 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1093 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1491  N-6 DNA methylase  22.12 
 
 		 495 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  30.48 
 
 		 518 aa  60.1  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  23.64 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  22.63 
 
 		 1058 aa  59.3  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0309  hypothetical protein  20.42 
 
 		 691 aa  58.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  23.67 
 
 		 710 aa  58.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  24.53 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  20.75 
 
 		 937 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  21.97 
 
 		 908 aa  58.2  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  22.81 
 
 		 595 aa  57.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4725  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1022 aa  57.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  23.53 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0324  N-6 DNA methylase  21.79 
 
 		 657 aa  57.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00528654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  21.82 
 
 		 481 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  26.06 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  25.45 
 
 		 500 aa  56.6  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  24.35 
 
 		 914 aa  56.6  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  22.52 
 
 		 527 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  28.31 
 
 		 1159 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1120 aa  55.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  29.09 
 
 		 1231 aa  55.5  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  33.05 
 
 		 1338 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1209 aa  55.5  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1177 aa  54.7  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  27.8 
 
 		 871 aa  54.7  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  23.71 
 
 		 534 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3644  type I restriction enzyme R protein N terminus (HSDR_N)/N-6 DNA methylase  23.11 
 
 		 866 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550519  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0332  N-6 DNA methylase  26.9 
 
 		 709 aa  54.3  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0004  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.19 
 
 		 517 aa  53.9  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  25.45 
 
 		 501 aa  53.9  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3910  N-6 DNA methylase  27.27 
 
 		 356 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1426 aa  53.9  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  21.96 
 
 		 918 aa  53.5  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  30.47 
 
 		 1076 aa  53.5  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0972  N-6 DNA methylase  22.37 
 
 		 911 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.91965 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4265  type I restriction-modification system, M subunit  24.4 
 
 		 537 aa  52.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  26.78 
 
 		 529 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  25.45 
 
 		 493 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  26.78 
 
 		 529 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 540 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2236  N-6 DNA methylase  24.67 
 
 		 528 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2925  N-6 DNA methylase  37.37 
 
 		 680 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  31.45 
 
 		 549 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  22.47 
 
 		 478 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2666  type I restriction-modification system specificity subunit  25.96 
 
 		 508 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289078  normal  0.157244 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  22.49 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3192  N-6 DNA methylase  22.37 
 
 		 605 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  24.35 
 
 		 505 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  23.83 
 
 		 921 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  21.82 
 
 		 493 aa  52.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  25.15 
 
 		 496 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  24.24 
 
 		 502 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  24.88 
 
 		 629 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  22.7 
 
 		 1432 aa  52.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.87 
 
 		 703 aa  51.6  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  23.14 
 
 		 481 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  23.62 
 
 		 918 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1712  N-6 DNA methylase  27.27 
 
 		 662 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.857909  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3600  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  22.54 
 
 		 530 aa  52  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  23.01 
 
 		 573 aa  51.2  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  21.72 
 
 		 621 aa  51.6  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  25.99 
 
 		 1002 aa  50.8  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  21 
 
 		 519 aa  50.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.05 
 
 		 549 aa  50.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  23.55 
 
 		 533 aa  51.2  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2365  N-6 DNA methylase  22.26 
 
 		 526 aa  51.2  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.725173  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  23.78 
 
 		 539 aa  50.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  22.99 
 
 		 504 aa  50.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>