More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3192 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3192  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 605 aa  1255    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1145  N-6 DNA methylase  30.04 
 
 		 628 aa  156  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1224  N-6 DNA methylase  29.07 
 
 		 796 aa  147  5e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.708606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1457  type I restriction-modification system, M subunit, putative  27.95 
 
 		 684 aa  145  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5290  N-6 DNA methylase  29.44 
 
 		 668 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.48 
 
 		 654 aa  135  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0518055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0324  N-6 DNA methylase  25.66 
 
 		 657 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00528654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  26.54 
 
 		 707 aa  128  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3247  N-6 DNA methylase  27.56 
 
 		 748 aa  127  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3644  type I restriction enzyme R protein N terminus (HSDR_N)/N-6 DNA methylase  28.15 
 
 		 866 aa  127  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550519  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0689  DNA methylase-type I restriction-modification system  26.58 
 
 		 687 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3600  N-6 DNA methylase  26.78 
 
 		 738 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0921  N-6 DNA methylase  28.41 
 
 		 676 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03611  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.07 
 
 		 548 aa  111  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  25.75 
 
 		 484 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  26.93 
 
 		 481 aa  106  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  26.25 
 
 		 775 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  26.62 
 
 		 492 aa  103  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  24.87 
 
 		 513 aa  103  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  25.07 
 
 		 506 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  24.49 
 
 		 477 aa  103  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_002950  PG0544  type I restriction-modification system, M subunit, putative  25.87 
 
 		 648 aa  102  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1016  N-6 DNA methylase  27.85 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  27.33 
 
 		 570 aa  102  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  28.1 
 
 		 808 aa  101  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  24.65 
 
 		 544 aa  100  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 481 aa  100  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  26.97 
 
 		 814 aa  100  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  24.65 
 
 		 544 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  27.44 
 
 		 492 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  30.32 
 
 		 503 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  24.2 
 
 		 489 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  24.77 
 
 		 481 aa  98.6  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  25.59 
 
 		 499 aa  98.6  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  26.51 
 
 		 553 aa  98.2  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  24.2 
 
 		 490 aa  98.2  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  27.19 
 
 		 517 aa  98.2  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0807  DNA-methyltransferase, type I restriction-modification enzyme subunit M  26.73 
 
 		 486 aa  97.4  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.444408  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  27.52 
 
 		 477 aa  96.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  27.15 
 
 		 545 aa  96.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  25.59 
 
 		 500 aa  96.7  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  26.61 
 
 		 502 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  27.6 
 
 		 860 aa  96.3  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  24.37 
 
 		 478 aa  95.5  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0823  N-6 DNA methylase  24.36 
 
 		 768 aa  95.9  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0181192  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  24.94 
 
 		 513 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1096  N-6 DNA methylase  25.62 
 
 		 486 aa  95.9  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02064  type I restriction enzyme EcoKI M protein  24.88 
 
 		 514 aa  95.1  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  24.61 
 
 		 554 aa  95.5  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  26.54 
 
 		 481 aa  95.1  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  26.16 
 
 		 553 aa  94.7  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  25.76 
 
 		 489 aa  94.7  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  24.75 
 
 		 506 aa  94.7  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  27.07 
 
 		 540 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  23.97 
 
 		 489 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  24.89 
 
 		 489 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  25.48 
 
 		 493 aa  94.4  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3600  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.23 
 
 		 530 aa  94  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.13 
 
 		 462 aa  94  7e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  26.83 
 
 		 539 aa  94  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  22.61 
 
 		 508 aa  93.6  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  27.47 
 
 		 846 aa  92.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4265  type I restriction-modification system, M subunit  26.36 
 
 		 537 aa  92  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3672  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.65 
 
 		 533 aa  91.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  21.9 
 
 		 505 aa  91.3  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  23.19 
 
 		 514 aa  91.3  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  26.95 
 
 		 489 aa  91.3  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  25.7 
 
 		 500 aa  91.3  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  26.8 
 
 		 494 aa  90.9  6e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  23.21 
 
 		 490 aa  90.9  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  28.1 
 
 		 481 aa  90.5  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2909  N4/N6-methyltransferase family protein  23.62 
 
 		 515 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  24.63 
 
 		 498 aa  90.5  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1992  N-6 DNA methylase  25.23 
 
 		 479 aa  90.5  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0409108  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  24.62 
 
 		 489 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.729594 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  23.36 
 
 		 544 aa  89.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  24.37 
 
 		 496 aa  90.1  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  26.05 
 
 		 519 aa  89.4  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  24.72 
 
 		 814 aa  89  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  26.06 
 
 		 489 aa  89  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  23.61 
 
 		 527 aa  89  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1577  type I restriction-modification system, M subunit  24.23 
 
 		 484 aa  89.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  28.21 
 
 		 509 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  25.65 
 
 		 891 aa  89.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0753  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.15 
 
 		 534 aa  89  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  25.74 
 
 		 488 aa  89.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5277  N-6 DNA methylase  28.53 
 
 		 571 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  25.06 
 
 		 537 aa  89  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  25.51 
 
 		 488 aa  88.6  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  25.06 
 
 		 537 aa  89  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  25.48 
 
 		 527 aa  88.6  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0750  type I restriction-modification system, M subunit  25.47 
 
 		 544 aa  88.2  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3570  N-6 DNA methylase  26.4 
 
 		 484 aa  87.8  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.054861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  27.96 
 
 		 486 aa  87.8  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  25.79 
 
 		 501 aa  87.8  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  23.89 
 
 		 489 aa  87.8  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  25.69 
 
 		 484 aa  87.4  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  26.47 
 
 		 816 aa  87  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2478  N-6 DNA methylase  25.88 
 
 		 881 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  24.75 
 
 		 568 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>