More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0689 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0544  type I restriction-modification system, M subunit, putative  60.83 
 
 		 648 aa  821    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0689  DNA methylase-type I restriction-modification system  100 
 
 		 687 aa  1412    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3247  N-6 DNA methylase  58.33 
 
 		 748 aa  719    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0921  N-6 DNA methylase  51.77 
 
 		 676 aa  642    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3600  N-6 DNA methylase  56.06 
 
 		 738 aa  856    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  30.72 
 
 		 654 aa  241  4e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0518055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0324  N-6 DNA methylase  30.17 
 
 		 657 aa  233  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00528654  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1457  type I restriction-modification system, M subunit, putative  25.43 
 
 		 684 aa  194  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0823  N-6 DNA methylase  22.36 
 
 		 768 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0181192  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1224  N-6 DNA methylase  25.08 
 
 		 796 aa  126  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.708606 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3192  N-6 DNA methylase  26.58 
 
 		 605 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0972  N-6 DNA methylase  25.97 
 
 		 911 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.91965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03611  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.11 
 
 		 548 aa  117  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  28.45 
 
 		 544 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  26.38 
 
 		 545 aa  115  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  28.18 
 
 		 544 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  28.53 
 
 		 544 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  25.71 
 
 		 540 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  26.57 
 
 		 508 aa  110  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3644  type I restriction enzyme R protein N terminus (HSDR_N)/N-6 DNA methylase  25.49 
 
 		 866 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550519  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3541  N-6 DNA methylase  23.74 
 
 		 524 aa  107  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  28.35 
 
 		 513 aa  107  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  25.97 
 
 		 527 aa  107  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  27.16 
 
 		 834 aa  106  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  24.92 
 
 		 499 aa  105  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  24.2 
 
 		 730 aa  102  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  24.34 
 
 		 513 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  27.66 
 
 		 517 aa  102  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  23.82 
 
 		 484 aa  102  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.86 
 
 		 504 aa  101  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  25.41 
 
 		 506 aa  100  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  25.95 
 
 		 553 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  25.08 
 
 		 549 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  25.3 
 
 		 775 aa  99.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  24.6 
 
 		 553 aa  99  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  23.03 
 
 		 570 aa  99.8  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  23.3 
 
 		 505 aa  99.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  25.61 
 
 		 489 aa  99.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  24.81 
 
 		 1005 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  26.25 
 
 		 846 aa  98.6  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  23.5 
 
 		 554 aa  99  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1059  N-6 DNA methylase  25.08 
 
 		 516 aa  97.4  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  23.68 
 
 		 506 aa  95.5  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  25.09 
 
 		 492 aa  94.4  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0389  N-6 DNA methylase  27.67 
 
 		 818 aa  94  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3181  N-6 DNA methylase  24.63 
 
 		 512 aa  92.8  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  21.85 
 
 		 579 aa  92.8  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  25.63 
 
 		 707 aa  92.8  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  27.08 
 
 		 498 aa  90.5  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 492 aa  87.8  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  27.24 
 
 		 496 aa  87.4  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  25.96 
 
 		 539 aa  86.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  26.54 
 
 		 498 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2418  N-6 DNA methylase  23.68 
 
 		 493 aa  85.9  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0240611  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  24.88 
 
 		 481 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  22.33 
 
 		 494 aa  84  0.000000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3011  N-6 DNA methylase  25.41 
 
 		 563 aa  83.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.467528  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  26.6 
 
 		 481 aa  84  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  24.48 
 
 		 490 aa  82.8  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  24.88 
 
 		 481 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  26.25 
 
 		 500 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  24.65 
 
 		 908 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02064  type I restriction enzyme EcoKI M protein  25.48 
 
 		 514 aa  82  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  23.94 
 
 		 489 aa  80.9  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3672  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.99 
 
 		 533 aa  79.7  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  22.08 
 
 		 481 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4265  type I restriction-modification system, M subunit  25.32 
 
 		 537 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1096  N-6 DNA methylase  23.42 
 
 		 486 aa  79  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  25.8 
 
 		 814 aa  78.6  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 499 aa  77.8  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  24.41 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5290  N-6 DNA methylase  33.33 
 
 		 668 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  25.76 
 
 		 499 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  23.69 
 
 		 489 aa  76.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.729594 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2961  N-6 DNA methylase  25.08 
 
 		 530 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1564  restriction modification system DNA specificity domain protein  26 
 
 		 1134 aa  75.5  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  25.14 
 
 		 505 aa  75.5  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3648  N-6 DNA methylase  23.21 
 
 		 529 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  25.62 
 
 		 489 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  20.7 
 
 		 490 aa  74.3  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4931  type I restriction enzyme EcoKI M protein  24.17 
 
 		 529 aa  74.3  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  23.65 
 
 		 822 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1671  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  24.61 
 
 		 529 aa  73.9  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.552607  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  22.93 
 
 		 815 aa  73.6  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  25 
 
 		 495 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04215  DNA methylase M  23.69 
 
 		 529 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0844  type I restriction enzyme EcoKI M protein  24.6 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14895e-23 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04181  hypothetical protein  23.69 
 
 		 529 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  26.98 
 
 		 489 aa  72.8  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  26.55 
 
 		 484 aa  72  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  25.07 
 
 		 504 aa  72  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3600  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  23.66 
 
 		 530 aa  72.4  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  22.74 
 
 		 493 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  25.09 
 
 		 493 aa  72  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  22.01 
 
 		 554 aa  71.6  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5277  N-6 DNA methylase  22.79 
 
 		 571 aa  71.6  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  23.57 
 
 		 477 aa  71.6  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1016  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 485 aa  71.6  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  25.08 
 
 		 508 aa  71.2  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  25.08 
 
 		 523 aa  71.2  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>