269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0921 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0544  type I restriction-modification system, M subunit, putative  51.75 
 
 		 648 aa  642    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0921  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 676 aa  1377    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0689  DNA methylase-type I restriction-modification system  51.9 
 
 		 687 aa  662    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3600  N-6 DNA methylase  48.58 
 
 		 738 aa  655    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3247  N-6 DNA methylase  46.93 
 
 		 748 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  28.28 
 
 		 654 aa  233  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0518055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0324  N-6 DNA methylase  27.86 
 
 		 657 aa  214  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00528654  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1457  type I restriction-modification system, M subunit, putative  24.62 
 
 		 684 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3192  N-6 DNA methylase  28.41 
 
 		 605 aa  115  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3644  type I restriction enzyme R protein N terminus (HSDR_N)/N-6 DNA methylase  26.09 
 
 		 866 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550519  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3541  N-6 DNA methylase  27.74 
 
 		 524 aa  104  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  26.43 
 
 		 513 aa  103  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  27.78 
 
 		 846 aa  103  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03611  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.72 
 
 		 548 aa  103  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  25.5 
 
 		 545 aa  103  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  24.65 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  25.84 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  27.88 
 
 		 513 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0823  N-6 DNA methylase  22.59 
 
 		 768 aa  102  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0181192  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  25.31 
 
 		 484 aa  100  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  27.24 
 
 		 834 aa  100  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  24.64 
 
 		 540 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  26.64 
 
 		 517 aa  99.4  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  27.56 
 
 		 775 aa  98.6  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  29.18 
 
 		 544 aa  97.8  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  26.45 
 
 		 544 aa  97.4  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  25.81 
 
 		 707 aa  97.1  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  28.11 
 
 		 544 aa  97.1  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.91 
 
 		 504 aa  95.9  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0389  N-6 DNA methylase  28.49 
 
 		 818 aa  95.5  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231606 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  23.25 
 
 		 499 aa  95.5  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  25.08 
 
 		 527 aa  94.4  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1059  N-6 DNA methylase  26.84 
 
 		 516 aa  93.6  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2418  N-6 DNA methylase  26.81 
 
 		 493 aa  92.8  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0240611  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  22.33 
 
 		 505 aa  92  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  23.58 
 
 		 554 aa  91.7  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  25.3 
 
 		 1005 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  24 
 
 		 489 aa  87.8  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  24.3 
 
 		 492 aa  87.8  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3181  N-6 DNA methylase  25.74 
 
 		 512 aa  87.8  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  25.08 
 
 		 549 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  23.21 
 
 		 570 aa  87  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  21.77 
 
 		 730 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  23.51 
 
 		 553 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3011  N-6 DNA methylase  25.94 
 
 		 563 aa  84  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.467528  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  22.46 
 
 		 553 aa  84  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  27.06 
 
 		 494 aa  82.4  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1224  N-6 DNA methylase  25.39 
 
 		 796 aa  82  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.708606 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  21.73 
 
 		 579 aa  81.6  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  23.08 
 
 		 508 aa  81.6  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  26.12 
 
 		 822 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0972  N-6 DNA methylase  23.93 
 
 		 911 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.91965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  24.3 
 
 		 493 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  29.15 
 
 		 492 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  25.3 
 
 		 489 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  22.14 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  24.9 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  26.09 
 
 		 489 aa  76.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  25.44 
 
 		 908 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  25.62 
 
 		 503 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  23.35 
 
 		 481 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  23.29 
 
 		 489 aa  76.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.729594 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  26.88 
 
 		 489 aa  75.5  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  22.54 
 
 		 490 aa  75.5  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  26.88 
 
 		 489 aa  75.5  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  23.85 
 
 		 501 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  26.74 
 
 		 488 aa  75.1  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1564  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.84 
 
 		 1134 aa  74.7  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  24.51 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  27.2 
 
 		 502 aa  74.3  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  23.98 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  20.59 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  27.04 
 
 		 488 aa  74.3  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  26.32 
 
 		 489 aa  73.9  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  26.12 
 
 		 498 aa  73.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  25.09 
 
 		 1343 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  25.34 
 
 		 808 aa  72.8  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  26.42 
 
 		 493 aa  73.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  24.22 
 
 		 500 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  24.11 
 
 		 500 aa  72  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  25.68 
 
 		 499 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  24.39 
 
 		 493 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  24.67 
 
 		 824 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1393  restriction and modification enzyme CjeI  25 
 
 		 1285 aa  71.6  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  23.69 
 
 		 710 aa  71.2  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  25.42 
 
 		 574 aa  70.9  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  26.46 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4265  type I restriction-modification system, M subunit  26.49 
 
 		 537 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  24.49 
 
 		 477 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  24.66 
 
 		 539 aa  70.1  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  24.02 
 
 		 527 aa  69.7  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  25.42 
 
 		 574 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1096  N-6 DNA methylase  24.72 
 
 		 486 aa  69.7  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  26.02 
 
 		 498 aa  68.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  25.08 
 
 		 585 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5290  N-6 DNA methylase  35.43 
 
 		 668 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  25.68 
 
 		 499 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3600  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  24.24 
 
 		 530 aa  68.9  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  26.12 
 
 		 500 aa  68.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0841  type I restriction-modification system, M subunit  25.4 
 
 		 484 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>