More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0972 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0972  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 911 aa  1840    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.91965 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1564  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.06 
 
 		 1134 aa  176  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.08 
 
 		 654 aa  155  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0518055 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  27.13 
 
 		 1343 aa  142  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1457  type I restriction-modification system, M subunit, putative  25.39 
 
 		 684 aa  129  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0324  N-6 DNA methylase  26.06 
 
 		 657 aa  122  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00528654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0689  DNA methylase-type I restriction-modification system  25.97 
 
 		 687 aa  120  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1393  restriction and modification enzyme CjeI  23.49 
 
 		 1285 aa  118  3.9999999999999997e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3247  N-6 DNA methylase  23.31 
 
 		 748 aa  104  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  29.04 
 
 		 579 aa  104  9e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1224  N-6 DNA methylase  23.85 
 
 		 796 aa  103  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.708606 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  28.57 
 
 		 707 aa  103  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  27.55 
 
 		 505 aa  101  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  24.92 
 
 		 730 aa  97.1  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  27.39 
 
 		 570 aa  94.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0823  N-6 DNA methylase  22.84 
 
 		 768 aa  94  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0181192  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  26.35 
 
 		 527 aa  92.8  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  24.62 
 
 		 544 aa  92  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  23.29 
 
 		 506 aa  91.3  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  24.76 
 
 		 508 aa  91.3  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  27.08 
 
 		 554 aa  91.3  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  25.93 
 
 		 489 aa  90.5  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  25.25 
 
 		 545 aa  90.9  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  26.55 
 
 		 489 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  28.18 
 
 		 490 aa  90.1  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3644  type I restriction enzyme R protein N terminus (HSDR_N)/N-6 DNA methylase  26.2 
 
 		 866 aa  90.1  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550519  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  23.87 
 
 		 544 aa  89.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  23.87 
 
 		 544 aa  89.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  26.44 
 
 		 553 aa  90.1  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  27.39 
 
 		 481 aa  88.6  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  26.17 
 
 		 489 aa  88.6  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  26.1 
 
 		 553 aa  88.2  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  25.6 
 
 		 493 aa  87.8  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  26.27 
 
 		 549 aa  87.4  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  25.6 
 
 		 489 aa  87.8  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  26.44 
 
 		 489 aa  87.4  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  26.16 
 
 		 493 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  26.44 
 
 		 489 aa  87.4  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  26.71 
 
 		 481 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  25.94 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  25.68 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  26.73 
 
 		 481 aa  85.1  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  29.41 
 
 		 846 aa  84.3  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3192  N-6 DNA methylase  28.12 
 
 		 605 aa  84.3  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  27.87 
 
 		 477 aa  84.3  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  26.26 
 
 		 500 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  25.85 
 
 		 493 aa  84  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  25.84 
 
 		 500 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  25.53 
 
 		 494 aa  83.2  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  25.73 
 
 		 499 aa  83.2  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  25.68 
 
 		 488 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  24.01 
 
 		 513 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  25.74 
 
 		 517 aa  82.8  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  23.37 
 
 		 506 aa  82.8  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  25.74 
 
 		 501 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  28.87 
 
 		 834 aa  82.8  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  25.34 
 
 		 478 aa  82.8  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  25.76 
 
 		 481 aa  81.6  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  24.68 
 
 		 814 aa  81.6  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  26.17 
 
 		 484 aa  81.3  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  26.07 
 
 		 799 aa  81.3  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  25.42 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1145  N-6 DNA methylase  24.5 
 
 		 628 aa  80.9  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  25.21 
 
 		 809 aa  80.9  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  25.6 
 
 		 540 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  22.74 
 
 		 484 aa  80.1  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  22.74 
 
 		 489 aa  80.1  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  28 
 
 		 873 aa  79.3  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1016  N-6 DNA methylase  25.08 
 
 		 485 aa  79.3  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  23.59 
 
 		 513 aa  79  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  26.2 
 
 		 775 aa  78.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3772  N-6 DNA methylase  24.28 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  26.26 
 
 		 494 aa  78.2  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3845  N-6 DNA methylase  24.28 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  24.51 
 
 		 508 aa  77.8  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0004  N-6 DNA methylase  25.15 
 
 		 710 aa  77.8  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.702722  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  26.36 
 
 		 585 aa  77  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  24.51 
 
 		 523 aa  77.4  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  27.91 
 
 		 574 aa  77.4  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  23.23 
 
 		 502 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2413  N-6 DNA methylase  23.99 
 
 		 494 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  26.25 
 
 		 480 aa  76.3  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  22.86 
 
 		 528 aa  76.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  23.47 
 
 		 492 aa  76.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  23.61 
 
 		 526 aa  76.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0389  N-6 DNA methylase  25.25 
 
 		 818 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231606 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04215  DNA methylase M  24.52 
 
 		 529 aa  75.1  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04181  hypothetical protein  24.52 
 
 		 529 aa  75.1  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4931  type I restriction enzyme EcoKI M protein  24.64 
 
 		 529 aa  75.1  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  26.92 
 
 		 822 aa  74.7  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3648  N-6 DNA methylase  24.57 
 
 		 529 aa  74.3  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  24.52 
 
 		 815 aa  74.7  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  27.9 
 
 		 490 aa  73.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  24.84 
 
 		 526 aa  73.9  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  26.89 
 
 		 495 aa  74.3  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1712  N-6 DNA methylase  25.36 
 
 		 662 aa  73.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.857909  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  25.54 
 
 		 495 aa  73.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  24.83 
 
 		 479 aa  73.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  25.69 
 
 		 484 aa  73.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  25.83 
 
 		 492 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>